数据集概述
本数据集包含布氏锥虫血液形态(细长型与粗短型)的显微图像及对应标注,用于支持寄生虫生命周期阶段的自动化分类研究。数据覆盖不同图像质量、细胞排列与形态特征,辅以训练/测试/验证划分及模型测试结果文件,适用于寄生虫学、机器学习及计算生物学领域的研究与算法开发。
文件详解
- 图像数据文件
- 文件名称:train.zip、test.zip、validation.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含标准成像条件下捕获的布氏锥虫血液形态显微图像,覆盖多样图像质量、细胞排列及形态特征
- 标注数据文件
- 文件内容:随图像文件提供的标注信息,指定每个图像中细胞形态为细长型或粗短型,支持监督式机器学习应用
- 补充文件
- 文件名称:Parasite_Seg_Cellpose(cyto3).ipynb、Parasite_CLF(V3).ipynb
- 文件格式:IPYNB
- 字段映射介绍:包含训练、测试、验证集划分信息及模型测试结果,用于模型评估;集成Cellpose分割算法与定制训练的Xception分类模型,模型分类准确率达97%
数据来源
Zenodo平台公开数据集
适用场景
- 寄生虫生命周期阶段分类研究: 分析布氏锥虫血液形态(细长型与粗短型)的显微图像,支持寄生虫生物学及传播动力学研究
- 机器学习模型开发: 为单细胞图像分割与分类算法提供训练、测试与验证数据,用于算法开发与性能基准测试
- 细胞形态学分析: 探索布氏锥虫不同生命周期阶段的形态特征模式,辅助寄生虫适应机制研究
- 跨领域算法迁移: 基于本数据集优化的机器学习方法可迁移至其他单细胞成像分类应用场景