数据集概述
本数据集包含拟南芥生物钟基因调控网络的数学模型，从P2011模型迭代优化至U2020.3版本，涵盖理论修正、参数缩放及全局优化等过程。数据还包括输入文件、模型开发的计算环境（Docker镜像）及相关模型文件，支持模型可重复性验证。
文件详解
- 文件名称：investigation-170-3.ro.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：压缩包内包含拟南芥生物钟模型的输入数据文件、模型开发的计算环境（Docker镜像）、相关模型文件（含U2019.1至U2020.3及KF2014模型文件），以及论文的biorXiv预印本链接。
数据来源
论文“Testing the inferred transcription rates of a dynamic, gene network model in absolute units”（Urquiza-Garcia and Millar, In Silico Plants, 2021）
适用场景
- 植物生物钟模型优化研究：分析从P2011到U2020.3模型的迭代过程，验证参数缩放与全局优化对模型性能的影响。
- 基因调控网络动态分析：基于模型数据探究拟南芥生物钟基因调控网络的转录速率及动态变化机制。
- 计算生物学模型可重复性验证：利用Docker镜像复现模型开发环境，验证模型结果的可靠性。
- 植物分子生物学研究：为拟南芥生物钟相关基因功能及调控机制研究提供数学模型参考。
