数据集概述
本数据集为论文“Visual integration of omics data to improve 3D models of fungal chromosomes”的补充数据，包含3DGB工作流所需的参数文件、生成的真菌基因组三维结构文件、代表性结构动画及原始组学数据分析汇总表，总计31个文件，用于支持真菌染色体三维模型的构建与分析。
文件详解
- 参数文件（Config files）
- 文件名称：遵循
config_*模式（例如：config_s_pombe_120min.yml）
- 文件格式：YML
- 字段映射介绍：共13个，为3DGB工作流生成真菌基因组三维模型的配置参数文件
- 三维结构文件（Data files）
- 文件名称：遵循
*_*.pdb模式（例如：SPOMB_30min.pdb、NCRAS_WT_annotated_H3K27.pdb）
- 文件格式：PDB
- 字段映射介绍：共13个，为生成的真菌染色体三维结构文件
- 动画文件（Animated GIF）
- 文件名称：遵循
*_annotated_*.gif模式（例如：NCRAS_hp0_annotated_H3K27me3.gif）
- 文件格式：GIF
- 字段映射介绍：共4个，为真菌染色体三维结构的代表性动画文件
- 原始数据分析汇总表（Raw data summary）
- 文件名称：raw_data_analysis_summary.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：1个，列出本研究使用的原始组学数据（Hi-C和ChIP-seq）及相关分析信息
数据来源
论文“Visual integration of omics data to improve 3D models of fungal chromosomes”
适用场景
- 真菌基因组三维结构研究：利用PDB文件分析不同真菌（如裂殖酵母、粗糙脉孢菌、酿酒酵母）的染色体三维结构特征
- 组学数据整合分析：通过XLSX文件中的原始数据信息，研究Hi-C与ChIP-seq数据整合对三维模型构建的优化作用
- 生物信息学工作流验证：基于YML参数文件复现3DGB工作流的真菌染色体三维模型构建过程
- 基因组结构可视化研究：借助GIF动画文件展示真菌染色体三维结构的动态特征与关键区域分布
