数据集概述
本数据集为关于VPS13B在高尔基体膜间隙定位及与FAM177A1功能伙伴关系研究的支撑数据,包含主图1-4及补充图1-3的原始实验数据、量化结果与图像文件,支持相关研究的复现与验证。
文件详解
该数据集包含多种格式的实验数据文件,具体说明如下:
- 主图与补充图数据文件:
- Main Fig. 1C frameinfo.csv: CSV格式,含GlobalIndex、StagePos、Timepoint等实验帧信息字段
- Localization_precision_ Figures 1H, 2F, Table S7, Table S9.csv: CSV格式,记录GM130、VPS13B等目标蛋白的定位精度(nm)数据
- Fig3D_rawdata_.xlsx: Excel格式,图3D的原始量化数据
- Fig. S3K_vps13b-qpcr-10oct23 - Quantification Cq Results.xlsx: Excel格式,qPCR实验的Cq值量化结果
- FigS3H_rawdata.xlsx: Excel格式,补充图3H的原始数据
- Fig3D quantification.pzfx、FigS3H_quantification.pzfx: PZFX格式,实验量化结果文件
- 结构预测与可视化文件:
- AF2_FigS1D.pse、AF2_Fig S3I.pse等.pse格式文件(共4个): 蛋白质结构相关的可视化文件
- 图像与视频源文件:
- AF2_Fig4A.png: PNG格式图像文件
- Fig. 1I and Video1 source file.tif、FigS1F_VapGFP_VPS13BHalo_GalTRFP_H2O.tif等.tif格式文件(共4个): 实验图像与视频源文件
- 模型训练与其他文件:
- Ilastik trained Data (Golgi reformation).ilp: ILP格式,需Ilastik软件打开的高尔基体重构训练数据
- Main Fig. 1C.mat: MAT格式数据文件
适用场景
- 细胞生物学研究: 分析VPS13B蛋白在高尔基体的亚细胞定位机制
- 分子互作研究: 探究VPS13B与FAM177A1的功能伙伴关系
- 蛋白质结构分析: 基于AF2相关文件研究蛋白质结构特征
- 实验方法验证: 复现定位精度测量、qPCR等实验的分析流程
- 高尔基体功能研究: 结合训练数据探究高尔基体重构过程的分子机制