数据集概述
本数据集为非人灵长类肠道宿主-微生物组互作共表达网络分析的补充表格集合，包含14个Excel格式表格。内容涵盖模拟数据集分类评估、肠道部位通路差异、三类基因共表达网络边信息、基因模块组成与富集分析、微生物表达丰度及算法参数评估等，支撑宿主与微生物互作机制的研究。
文件详解
- 文件名称：Supplementary Table S9至S22（共14个，示例：Table_S13.xlsx、Table_S11.xlsx等）
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：
- Table S9：模拟数据集宿主与微生物RNA reads分类的评估及参数确定
- Table S10：盲肠相对横结肠显著上调的40条通路
- Table S11：宿主-微生物基因共表达网络边信息
- Table S12：宿主-宿主基因共表达网络边信息
- Table S13：微生物-微生物基因共表达网络边信息
- Table S14：共表达网络中每个基因模块包含的基因列表
- Table S15：每个基因模块的富集分析结果
- Table S16：宏转录组谱中表达丰度前32的细菌物种
- Table S17：KEGG数据库注释的微生物RNA reads数量
- Table S18：各参数下基因模块的富集分析结果
- Table S19：Newman算法各参数下的模块评估
- Table S20：Louvain算法各参数下的模块评估
- Table S21：Leiden算法各参数下的模块评估
- Table S22：WGCNA各参数下的模块评估
适用场景
- 宿主-微生物组互作机制研究：通过共表达网络边信息分析肠道宿主与微生物基因的关联模式
- 肠道部位功能差异分析：利用盲肠与横结肠的通路差异数据，探究肠道不同部位的代谢功能特征
- 微生物群落结构分析：基于细菌物种表达丰度数据，研究非人灵长类肠道微生物的组成及优势类群
- 生物信息学算法评估：对比Newman、Louvain等算法在基因模块识别中的性能，优化共表达网络分析流程
- 基因功能富集研究：通过模块富集分析结果，解析宿主与微生物基因的功能协同作用
