数据集概述
本数据集为尾噬菌体分类学重组研究的支撑数据，聚焦芽孢杆菌噬菌体SPO1相关病毒（原Spounavirinae亚科）的分类地位分析。通过比较基因组学、核心基因组分析、标记基因系统发育等方法，证实该类群应从肌病毒科（Myoviridae）独立为新科Herelleviridae，为尾噬菌体目（Caudovirales）分类体系重构提供依据。
文件详解
- 系统发育树文件（.nwk格式，共6个）：
- 2.b.DICE.transl_genomes.nwk：基于翻译基因组的DICE方法系统发育树
- 2.a.VICTOR.nucl_genomes.nwk：基于核苷酸基因组的VICTOR方法系统发育树
- 1.b.GRAViTy_BootstrappedUPGMATree.nwk：GRAViTy方法构建的带 bootstrap 验证的UPGMA树
- 3.b.GOAT.synteny.nwk：基于GOAT方法的基因同线性系统发育树
- 4.IQtree.concatenated_markers_10.nwk：IQ-TREE构建的10个串联标记基因系统发育树
- 3.a.VipTree.proteome.nwk：基于蛋白质组的VipTree方法系统发育树
- 表格文件（.xlsx格式，共4个）：
- Table S3.xlsx：补充表3，可能包含分类学评估相关数据
- Figure S2.xlsx：图S2的源数据，可能与系统发育分析结果相关
- Table S1.xlsx：补充表1，可能包含病毒基因组基本信息或分类特征数据
- 文档文件（.docx格式，1个）：
- Supplementary File 1 Materials & Methods.docx：补充材料1，详细描述研究使用的实验方法与分析流程
- 图片文件（.pdf、.tif格式，共3个）：
- Figure S3.pdf、Figure S4.pdf：补充图3、图4，可能展示分类学分析的可视化结果
- Figure S1.tif：补充图1，可能为核心分析结果的主图
数据来源
国际病毒分类委员会（ICTV）细菌与古菌病毒分委员会
适用场景
- 噬菌体分类学研究：为尾噬菌体目分类体系重构提供方法与数据参考
- 比较基因组学分析：用于验证病毒分类单元划分的基因组学标准
- 系统发育方法评估：可对比不同系统发育分析工具在噬菌体分类中的应用效果
- 病毒多样性研究：支持芽孢杆菌噬菌体SPO1相关病毒类群的遗传多样性分析
