数据集概述
本数据集为WikiPathways 2020年3月发布版本,包含人类(Homo sapiens)通路的GPML文件,以及GPMLRDF、WPRDF格式的转换文件和VOID RDF描述文件,数据以CCZero协议开放,共4个文件。
文件详解
- wikipathways-20200310-gpml-Homo_sapiens.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:包含人类通路的GPML原始文件
- wikipathways-20200310-rdf-gpml.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:GPML文件转换为RDF格式的文件包
- wikipathways-20200310-rdf-wp.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:WikiPathways通路数据转换为WPRDF格式的文件包
- wikipathways-20200310-rdf-void.ttl
- 文件格式:TTL
- 字段映射介绍:RDF数据集的VOID描述文件
数据来源
WikiPathways
适用场景
- 生物信息学研究:用于人类通路数据的存储、交换与分析
- 语义网应用:支持RDF格式通路数据的语义查询与整合
- 通路可视化工具开发:基于GPML文件构建通路可视化功能
- 生物医学数据集成:通过RDF转换文件实现跨平台通路数据共享