数据集概述
本数据集围绕新西兰岩鹪鹩（Xenicus gilviventris）种群结构展开，包含其遗传序列、基因型、地理距离及系统发育树等数据。通过微卫星、核DNA与线粒体DNA序列分析，揭示该濒危高山雀形目鸟类的南北种群分化特征，为验证更新世冰川避难所假说提供支持，共含十八个文件。
文件详解
- 系统发育树文件（.tree/.tre）
- 文件名称：cytb tree_beast.txt、MP beta_fib.tree、ML beta_fib.tree、Bayes 1stdomain cntl reg.tre、fig tree bfibphased.tre、Cntrl reg FULL.tre、ML cyt b.tree、ML Cntrl reg 1st dom.tree、MP cyt b.tree
- 文件格式：.tree、.tre、.txt
- 字段映射介绍：包含基于细胞色素b（cytb）、β-纤维蛋白内含子7（b-fib int7）、控制区（Cntrl reg）序列构建的最大简约法（MP）、最大似然法（ML）、贝叶斯法系统发育树，记录种群遗传分化关系
- 序列数据文件（.fasta）
- 文件名称：X. gilviventris b-fib int7 sequence data.fasta、X.gilviventris Cntrl Reg sequence data.fasta、X. gilviventris Cyt b sequence data.fasta
- 文件格式：FASTA
- 字段映射介绍：分别存储岩鹪鹩β-纤维蛋白内含子7、线粒体控制区、细胞色素b的核苷酸序列数据
- 基因型与地理距离文件（.xlsx）
- 文件名称：X. gilviventris genotyped individuals.xlsx、X. gilviventris pairwise geographic distances_North only.xlsx、X. gilviventris pairwise geographic distances_South only.xlsx、X. gilviventris pairwise geographic distances.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含基因分型个体信息、南北种群及全区域的地理距离数据
数据来源
论文“Population structure within an alpine archipelago: strong signature of past climate change in the New Zealand rock wren (Xenicus gilviventris)”
适用场景
- 生物地理学研究: 分析新西兰南岛高山脊椎动物种群分化与更新世冰川避难所的关系
- 气候变化响应研究: 探究历史气候变迁对高山群岛物种种群结构的影响，预测未来响应
- 种群遗传学分析: 利用微卫星、核DNA与线粒体DNA数据解析岩鹪鹩遗传多样性与分化模式
- 濒危物种保护: 基于种群结构特征制定岩鹪鹩的针对性保护策略
- 生物区系“间隙”现象解释: 验证冰川避难所假说对新西兰南岛中部低特有性区域的解释力
