数据集概述
该数据集包含小丑蝇（Chironomus riparius）重组景观及Cla元件相关的分阶段数据文件，涵盖德国黑森州等五个欧洲地区种群，涉及MELT、iSMC、PLINK及bedtools等工具生成的分析结果，为研究其基因组重组模式提供支持。
文件详解
- 压缩文件集合（均为.zip格式）：
- MELT.zip：含种群信息及编号的Cla插入片段数据，覆盖441个检测到的Cla元件
- iSMC相关文件：含1kb、10kb、100kb窗口的重组率rho数据
- bedtools分析文件：如bedtools_closest_ismc1kb_Cla.zip（1kb窗口下Cla元件与重组率距离分析）、bedtools_closest_ismc1kb_HB.zip（1kb窗口下单倍型块与重组率距离分析）等不同窗口尺度的分析结果
- plink_HB_allpop.zip：单倍型块检测数据
- input_files_figures.zip：生成图表所需的支持文件及完整统计表格
数据来源
GitHub（https://github.com/lpettrich/Crip_RecombinationLandscape_HB_2025）
适用场景
- 基因组学研究：分析小丑蝇不同种群的基因组重组率分布特征
- 分子遗传学：探究Cla元件在基因组中的位置及其与重组热点的关联
- 进化生物学：研究地理种群间的遗传结构与重组模式差异
- 生物信息学：验证不同生物信息工具（如iSMC、PLINK）在昆虫基因组分析中的应用效果
