新芽孢杆菌II型SMC_Wadjet复合体结构数据集

数据集概述

本数据集围绕新芽孢杆菌(Neobacillus vireti)的II型SMC Wadjet复合体结构展开,包含其重构模型、AlphaFold预测模型及相关实验图表。旨在揭示该类原核免疫复合物的独特结构特征,为理解Wadjet系统演化及功能提供数据支持。

文件详解

该数据集由多个目录和文件组成,具体说明如下: - 核心结构重构文件(位于 Wadjet_reconstructions/ 目录下): - ecJetABC_resting_state_reconstruction.pdb:静息态复合体结构重构文件,PDB格式 - ecJetABCD_cleavage_state_reconstruction.pdb:切割态复合体结构重构文件,PDB格式 - README_reconstructions.txt:重构说明文档,包含模型构建方法及用途说明 - 实验图表文件(位于 Figure_4/、Figure_S1/、Figure_S7/、Figure_S8/ 目录下): - 以.png、.tif、.pzfx为后缀的图表文件,如 Figure_4A_top.png、Figure_S1A.tif、Figure_S7D_ii.pzfx,记录实验结果可视化内容 - AlphaFold模型文件(位于 Alphafold_models/ 各子目录下): - 以.pdb、.json、.cif为后缀的模型文件,如 AF2_ecJetD_dimer/rank_1_model_3_ptm_seed_0_unrelaxed.pdb、AF3_nvJetD_dimer_Fig_FigS6/fold_bvjetd_model_0.cif - 包含预测模型结构、预测误差数据等辅助文件

适用场景

  • 分子生物学研究:分析II型SMC Wadjet复合体的结构特征及功能机制
  • 蛋白质结构预测验证:对比AlphaFold模型与实验重构结构的一致性
  • 原核免疫机制研究:探究Wadjet系统在质粒限制中的作用模式
  • 生物大分子演化分析:通过结构比较揭示SMC复合体家族的演化关系
  • 科学可视化支持:为学术论文或报告提供结构模型及实验图表素材
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数据与资源

该数据集没有数据

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.0 MiB
最后更新 2025年11月27日
创建于 2025年11月27日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。