数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫行为数据库的一部分,记录了RB1816品系gpa-16(ok2349)I基因突变体成年雌雄同体线虫的行为实验数据。实验在含OP50食物的NGM琼脂培养基中进行,通过视频跟踪获取线虫运动特征,包含原始跟踪数据及特征提取结果,可用于研究该基因突变对线虫行为的影响。
文件详解
- 核心数据文件(.hdf5格式)
- 文件名称:gpa-16 (ok2349) on food R_2011_02_08__11_42_08__3.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:包含线虫行为跟踪的原始数据,涉及时间序列、运动轨迹等基础观测信息
- 特征数据文件(.hdf5格式)
- 文件名称:gpa-16 (ok2349) on food R_2011_02_08__11_42_08__3_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:存储提取的线虫行为特征数据,基于tierpsy软件分析得到的运动参数
- 行为数据压缩文件(.zip格式)
- 文件名称:gpa-16 (ok2349) on food R_2011_02_08__11_42_08__3.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩存储的线虫行为数据文件,包含标准化的行为观测记录
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫基因功能研究: 分析gpa-16基因突变对秀丽隐杆线虫运动行为的影响机制
- 神经生物学实验验证: 验证G蛋白偶联受体基因在调控线虫行为中的作用
- 模式生物行为学分析: 作为模式生物行为研究的参考数据集,支持行为特征量化分析
- 生物信息学算法测试: 为线虫行为跟踪与特征提取算法(如tierpsy)提供实测数据验证
- 发育生物学研究: 探究成年线虫在特定食物环境下的行为模式与生理状态的关联