数据集概述
本数据集为秀丽隐杆线虫(C.elegans)VC602品系(基因型trp-2(gk298)III)的行为实验数据,记录了成年雌雄同体线虫在无食物条件下的运动行为。实验由MRC分子生物学实验室完成,数据包含视频追踪结果及特征提取文件,属于C.elegans行为数据库的一部分。
文件详解
- 文件名称:
trp-2 (ok298) off food L_2010_04_27__14_32_45___1___6.wcon.zip
- 文件格式:ZIP
- 字段映射介绍:压缩文件,可能包含线虫行为轨迹的标准格式数据
- 文件名称:
trp-2 (ok298) off food L_2010_04_27__14_32_45___1___6_features.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:线虫行为特征提取文件,存储由tierpsy软件分析得到的运动特征数据
- 文件名称:
trp-2 (ok298) off food L_2010_04_27__14_32_45___1___6.hdf5
- 文件格式:HDF5
- 字段映射介绍:线虫行为原始追踪数据文件,包含361个分割骨架数据,记录总时长28.644秒、帧率23.0415帧/秒、像素分辨率4.29558微米/像素
数据来源
C.elegans behavioural database(http://movement.openworm.org)
适用场景
- 线虫行为学研究:分析trp-2基因缺失对线虫运动模式、轨迹特征的影响
- 神经生物学实验:探究TRP通道在无食物条件下对线虫觅食行为的调控机制
- 模式生物行为标准化分析:基于tierpsy软件提取的特征,建立线虫行为量化分析模型
- 基因型与表型关联研究:对比不同基因型线虫在相同环境下的行为差异,解析基因功能
- 生物信息学工具验证:用于测试或优化线虫行为追踪软件(如tierpsy)的算法性能