数据集概述
本数据集围绕亚马逊细身安乐蜥(Anolis fuscoauratus)的性信号(喉扇颜色)变异展开,探究遗传分化、环境梯度及近缘物种共存对其变异的影响,为平行性状进化及信号性状在物种形成中的作用研究提供支持。
文件详解
- 数据文件(CSV格式):
- Table_S2_info_ddRAD_samples.csv:包含ddRAD样本信息,字段包括样本ID、属种、国家、州、地点、经纬度等地理参考数据
- Table_S1_data_species_cooccurrence.csv:物种共存数据,字段包括地点、喉扇分组、物种分布(如Anolis fuscoauratus不同颜色型及近缘物种的出现情况)
- Table_S3_data_environmental_analyses.csv:环境分析数据
- Table_S4_environmental_PCA_loadings.csv:环境PCA载荷数据
- 系统发育文件:
- Text_S2_phylogeny.tre:系统发育树文件(.tre格式)
- 压缩包文件:
- ddRAD_data.tar.gz:ddRAD测序数据压缩包
- scripts.tar.gz:分析脚本压缩包(包含R和Shell脚本)
- 文档与协议:
- README.txt:数据集说明文档
- Text_S1_extraction_protocol.pdf:DNA提取协议文档(PDF格式)
- Fig_S1_plot_environmental_variables.pdf:环境变量分析图(PDF格式)
适用场景
- 进化生物学研究:分析性信号性状的分化机制及物种间相互作用对性状进化的影响
- 生态学研究:探究环境因子与生物信号特征的关联及物种共存模式
- 生物信息学分析:利用ddRAD数据进行种群遗传结构及系统发育关系研究
- 保护生物学:为亚马逊地区爬行动物多样性保护及物种形成机制研究提供数据支持