数据集概述
本数据集包含亚平宁棕熊线粒体复合物I ND5亚基G527E突变的分子动力学模拟后处理数据,对比野生型、对照型及突变型三个系统的结构与功能特征,支持相关生物能量学研究的验证与可重复性。
文件详解
该数据集为压缩包文件,内部包含按分析主题分类的目录,具体如下:
- 文件名称: Apennine_Brown_Bear.zip
- 文件格式: ZIP压缩包
- 内部目录及内容:
- Figure_4/:含三个子目录
- A_RMSF/:不同系统选定主链原子的均方根波动(RMSF)数据
- B_Contacts/:每个系统三个重复样本的原子接触谱(15 Å内)
- D_Water/:ND5-ND4通道关键亚基界面的时间分辨水合数据
- Starting_coordinates/:每个系统三个模拟重复样本的GROMACS坐标文件(.gro格式)
- Supplementary_Figure_S4, S5, S6/:含ND5亚基PCA第一特征向量轨迹投影文件(.pdb格式)及复合物I关键水通道水合谱文件(.dat格式),文件名标注系统类型、测量类型及重复编号
适用场景
- 线粒体生物能量学研究:分析G527E突变对复合物I功能的影响
- 结构生物学分析:探究突变体与野生型的蛋白质结构动态差异
- 濒危物种保护研究:支持亚平宁棕熊遗传突变的功能验证
- 分子动力学方法应用:作为相关模拟技术的验证数据集