YassourM_2016婴儿肠道微生物组数据集

数据集概述

本数据集是经Nephele处理的YassourM_2016研究数据,聚焦婴儿肠道微生物组的自然发展历史,以及抗生素治疗对细菌菌株多样性和稳定性的影响,为相关医学研究提供数据支持。

文件详解

  • 元数据与映射文件:
  • YassourM_2016_metadata.csv:CSV格式,包含样本ID、研究名称、受试者ID、评估日、抗生素使用情况等元数据字段
  • mappingfile_corrected.txt.no_gz:文本格式,可能为样本映射信息文件
  • 微生物组数据文件:
  • taxonomy_table.txt:文本格式,包含Feature ID(特征ID)、Taxon(分类单元)等字段,记录微生物分类信息
  • OTU_table.txt:文本格式,操作分类单元(OTU)计数表
  • otu_summary_table.txt:文本格式,OTU汇总表
  • taxa.biom:BIOM格式,微生物分类数据文件
  • seq.fasta:FASTA格式,序列数据文件
  • 质量控制文件:
  • qualityProfile_R1.pdf、qualityProfile_R2.pdf:PDF格式,测序质量分布图
  • errorRate_R1.pdf、errorRate_R2.pdf:PDF格式,测序错误率报告
  • 日志与结果文件:
  • logfile.txt、logfile_debug.txt:文本格式,处理日志文件
  • Pipeline Results.zip:ZIP格式,流程处理结果压缩包

适用场景

  • 医学研究:分析婴儿肠道微生物组的自然发展规律
  • 抗生素影响研究:探究抗生素治疗对婴儿肠道细菌多样性的作用
  • 微生物组数据分析:支持肠道微生物分类、OTU分析等研究
  • 临床应用研究:为婴儿肠道健康相关临床研究提供数据参考
packageimg

数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 51.53 MiB
最后更新 2025年12月8日
创建于 2025年12月8日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。