野生啮齿动物肠道微生物群与栖息地影响研究数据集

数据集概述

本数据集是关于"过去与当前栖息地对野生啮齿动物肠道微生物群影响"研究的配套数据与代码文件。包含研究分析工作流文件、QIIME2提取的输入数据文件及结果文件,为复现该研究的数据分析过程提供完整支持。

文件详解

  • 分析工作流文件:
  • RT_workflow.qmd:Quarto格式文件,包含完整的R代码实现
  • RT_workflow.html:由Quarto文件生成的在线HTML格式分析报告
  • 输入数据文件(用于R工作流):
  • QIIME2提取的.qza格式文件(共6个):如shannon_vector.qza、rt_taxonomysilva.qza、rt_rooted-tree.qza、faith_pd_vector.qza、observed_features_vector.qza等
  • 文本文件(共3个):如metadata_quarto.txt(包含样本ID、类型、时间、遗传聚类等元数据)、distances_1_to_3_from_qiime.txt、differences_1_to_3_from_qiime.txt

适用场景

  • 微生物生态学研究:分析栖息地变化对野生动物肠道微生物群的影响机制
  • 生物信息学方法应用:探索QIIME2与R语言结合的微生物数据分析流程
  • 野生动物保护研究:评估栖息地环境因素对动物健康的潜在影响
  • 数据复现与验证:支持相关研究的结果验证与方法改进
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 6.36 MiB
最后更新 2025年12月15日
创建于 2025年12月15日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。