数据集概述
本数据集包含支持Wen等人2025年提交至《Environmental DNA》论文的相关数据与代码，围绕潟湖及暴露生境中硬珊瑚（Scleractinia）的环境DNA组成评估展开，为研究珊瑚物种鉴定与生境分析提供数据支持。
文件详解
- 数据文件：
- File S1 Confusion_Matrix.csv：CSV格式，包含混淆矩阵数据，用于模型性能评估
- CoralDB_Taxidmap.txt：TXT格式，包含分类单元ID与分类层级映射，如"PP133644"对应"NA;NA;NA;NA;NA;NA;NA"
- 序列文件：
- File S2 CoralDB.fasta：FASTA格式，珊瑚数据库序列文件
- CoralDB_with_taxonomy.fasta：FASTA格式，带分类信息的珊瑚数据库序列文件
- 模型与代码文件：
- File S3 CoralDB_IdtaxaClassifier.Rdata：RData格式，珊瑚分类器模型文件
- BW_Coral_eDNA_Project_Code.Rmd：RMarkdown格式，项目分析代码文档
- 文档文件：
- CoralDB_IdtaxaClassifier.pdf：PDF格式，分类器相关说明文档
适用场景
- 珊瑚礁生态学研究：分析不同生境中硬珊瑚物种组成与分布
- 环境DNA技术应用：评估eDNA技术在珊瑚物种鉴定中的准确性
- 生物多样性监测：通过eDNA数据监测珊瑚礁生态系统健康状况
- 分类学研究：基于DNA序列数据完善珊瑚分类体系
- 生态模型构建：利用混淆矩阵优化珊瑚物种识别模型性能
