数据集概述
本数据集基于硬松类（Pinus subsection Ponderosae）的系统基因组学研究，包含130个个体的样本数据，涉及703个低拷贝核基因序列和近完整质体基因组序列，用于构建系统发育树与物种树，分析核质一致性与网状进化关系。
文件详解
- 说明文档与结果文件：
- ReadMe.rtf：富文本格式说明文档，可能包含数据集整体介绍、样本信息及文件说明
- Willyard_etal_DryadFileS2_SeqResultsBySample.rtf：富文本格式文件，按样本呈现序列结果
- Willyard_etal_DryadFileS5_ResultsByGene.rtf：富文本格式文件，按基因呈现分析结果
- Willyard_etal_DryadFileS9_Monophyly.pdf：PDF格式文件，关于单系性分析的结果文档
- 序列数据文件：
- Willyard_etal_DryadFileS4_Plastomes.fasta：FASTA格式文件，包含质体基因组序列
- Willyard_etal_DryadFileS3_Nuclear.fasta：FASTA格式文件，包含核基因序列
- 图像文件：
- Willyard_etal_DryadFileS1_MapSamples.png：PNG格式图片，样本分布地图
- Willyard_etal_DryadFileS8_PlastomeMP.png：PNG格式图片，质体基因组最大简约法系统发育树
- Willyard_etal_DryadFileS7_Concat600LCN_MP.png：PNG格式图片，600个低拷贝核基因串联的最大简约法系统发育树
- Willyard_etal_DryadFileS6_Concat600LCN_RAxML_WithoutI.png：PNG格式图片，600个低拷贝核基因串联的RAxML法系统发育树（无I值）
适用场景
- 植物系统发育研究：分析硬松类物种的亲缘关系与分类学修订
- 基因组进化分析：探究核质基因组的一致性及网状进化模式
- 物种鉴定参考：为硬松类物种的分子鉴定提供数据支持
- 生物地理学研究：结合样本分布分析硬松类的地理演化历史
