数据集概述
本数据集为Zaura等人2015年研究的处理数据，聚焦抗生素暴露下唾液与粪便微生物组的响应差异，通过Nephele流程处理，包含微生物分类、序列、元数据等多类型文件，为微生物组耐药性与生态响应研究提供支持。
文件详解
- 微生物数据文件：
- taxa.biom：BIOM格式，存储微生物分类单元（OTU）的丰度数据
- taxonomy_table.txt：TXT格式，包含Feature ID与分类学信息映射（如Bacteria; Bacteroidetes等层级）
- seq.fasta：FASTA格式，存储微生物序列数据
- OTU_table.txt：TXT格式，记录OTU丰度表
- otu_summary_table.txt：TXT格式，提供OTU统计摘要
- 元数据文件：
- zaura metadata.csv：CSV格式，含样本基本信息（sample_id、subject_id、assessment_day、antibiotics_current_use等字段）
- mapping_file_corrected.txt.no_gz：TXT格式，样本映射文件
- 质量控制文件：
- qualityProfile_R1.pdf：PDF格式，测序质量分布图
- errorRate_R1.pdf：PDF格式，测序错误率分析图
- 日志文件：
- logfile.txt：TXT格式，流程运行日志
- logfile_debug.txt：TXT格式，调试日志
适用场景
- 微生物组耐药性研究：分析抗生素暴露对不同部位微生物组的影响差异
- 微生物生态响应分析：探究唾液与粪便微生物组的耐药性与恢复能力差异
- 临床微生物组研究：辅助研究抗生素使用对人体微生态的长期影响
- 生物信息学方法验证：用于测试微生物组数据分析流程的有效性
