正常肾上腺皮质空间转录组学处理数据集

数据集概述

该数据集包含人类正常肾上腺皮质的空间转录组学处理数据,涉及两个正常肾上腺样本。数据由Visium空间转录组技术生成,经Space Ranger软件处理,包含样本的图像文件与过滤后的表达矩阵,为研究肾上腺皮质的空间基因表达模式提供支持。

文件详解

该数据集包含18个文件,按样本分为表达矩阵文件和图像相关文件,具体如下: - 表达矩阵文件(每个样本3个): - _barcodes.tsv.gz:压缩文本格式,存储样本的条形码信息 - _features.tsv.gz:压缩文本格式,存储基因特征信息 - _matrix.mtx.gz:压缩矩阵格式,存储基因表达计数矩阵 (注:代表样本名称,如NAd4、NAd5) - 图像相关文件(每个样本6个): - _tissue_hires_image.png:高分辨率组织图像,PNG格式 - _tissue_lowres_image.png:低分辨率组织图像,PNG格式 - _aligned_fiducials.jpg:对齐基准点图像,JPG格式 - _detected_tissue_image.jpg:检测到的组织图像,JPG格式 - _scalefactors_json.json:缩放因子信息,JSON格式,包含tissue_hires_scalef等关键参数 - _tissue_positions_list.csv:组织位置列表,CSV格式,包含条形码、坐标等信息

适用场景

  • 肾上腺皮质空间基因表达模式分析
  • 正常肾上腺组织细胞类型空间分布研究
  • 空间转录组学数据处理方法验证
  • 内分泌器官组织微环境的分子机制研究
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 48.88 MiB
最后更新 2025年12月7日
创建于 2025年12月7日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。