真核生物着丝粒进化与系统发育起源数据集

数据集概述

本数据集围绕真核生物着丝粒进化展开,基于生命时间树项目的5万余种样本,通过Mk2和BiSSE模型分析染色体类型(单着丝粒/全着丝粒)的演化方向与速率,探究着丝粒组织形式的进化选择优势。

文件详解

  • 文件名称:Supplementary Figure 1.pdf,格式:PDF,内容:补充图表文件,可能包含着丝粒进化分析的可视化结果
  • 文件名称:Holocentric-Ancestral_Character-Estimation2.Rmd,格式:R Markdown,内容:R语言分析脚本,用于祖先特征状态估计的代码实现
  • 文件名称:TimetreeOfLife2015.nwk,格式:NWK,内容:生命时间树系统发育树文件,包含5万余种物种的演化关系
  • 文件名称:lista_JMC_ME2.csv,格式:CSV,字段:Species(物种名称)、Holocentric1(全着丝粒标记1)、Holocentric0(全着丝粒标记0),记录物种的着丝粒类型数据

适用场景

  • 进化生物学研究:分析真核生物着丝粒组织形式的演化历史与方向
  • 系统发育分析:基于生命时间树探究染色体类型的祖先状态与转换速率
  • 计算生物学应用:验证Mk2与BiSSE模型在特征进化分析中的差异
  • 遗传学研究:探索着丝粒结构对遗传信息传递与物种分化的影响机制
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 3.23 MiB
最后更新 2025年12月4日
创建于 2025年12月4日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。