数据集概述
本数据集记录真菌与兰花祖先线粒体基因组间的水平基因转移（HGT）证据，包含首个真菌与被子植物线粒体基因组大规模HGT的研究数据，涉及基因序列比对、blast分析结果等，为古老跨物种基因转移研究提供支持。
文件详解
- 文档类文件：
- NCBI Blast_Hexa_brev_extent_vs_Basidiomycota_RefSeq_Genomes.pdf：PDF格式，可能为NCBI Blast比对结果文档
- 序列比对文件（.phy格式）：
- atp6_orchid_fungi_alignment_curated.phy：兰花与真菌atp6基因的比对文件
- Erycina_mito_HGT_BAC_clones alignment.phy：Erycina属线粒体HGT BAC克隆的比对文件
- HGT_core_tRNAs_aligned_genera.phy：核心tRNA基因在不同属间的比对文件
- Orchid_HGT_extents_alignment_FINAL.phy：兰花HGT区域范围的最终比对文件
- 序列文件：
- dendrobium_ustilago_cox1_alignment.fasta：石斛属与黑粉菌cox1基因的fasta格式比对文件
- 文本文件：
- C_striata_187MT_100bp_interval_IDs.txt：文本格式，包含Corallorhiza striata线粒体100bp区间的ID信息，预览显示处理了137条序列（13653bp）
适用场景
- 植物与真菌线粒体基因组水平基因转移机制研究
- 兰花进化过程中与真菌共生关系的基因组学分析
- 被子植物线粒体基因组中非植物来源序列的化石证据研究
- 跨物种基因转移事件的分子进化分析
