智利阿塔卡马沙漠Tillandsia_landbeckii进化时间线数据集

数据集概述

本数据集围绕智利阿塔卡马沙漠特有植物Tillandsia landbeckii的进化时间线展开,包含基于全质体DNA序列数据的系统发育分析文件,涉及物种分化时间及与近缘种的遗传接触研究。

文件详解

  • partitions_for_raxml.txt:TXT格式,包含RAxML软件使用的分区信息,定义不同基因片段的进化模型(如TVM+G、K81UF+I+G等)及对应序列位置范围
  • Barcode_phylogeny_Tillandsiodes_raxml_support.tre:TRE格式,基于条形码数据构建的Tillandsiodes类群系统发育树,带有支持度信息
  • Concat_seqData_TillMixed_T.usAndAnanas.phy:PHY格式,Tillandsia混合类群与Ananas属的 concatenated 序列数据文件
  • Concat_seqData_TillMixed_T.usAndAnanas.phy.raxml.support:SUPPORT格式,上述PHY文件经RAxML分析后的支持度结果文件
  • Gene_list.xlsx:XLSX格式,基因列表文件,可能包含分析涉及的基因信息
  • Suppl_Fig_1.pdf:PDF格式,补充图1,可能为研究相关的图表
  • treeannotator_100M_newRoot3.nex:NEX格式,TreeAnnotator软件处理的树文件,用于时间树构建

适用场景

  • 植物系统发育研究:分析Tillandsia属物种的亲缘关系与进化历史
  • 沙漠植物适应性进化研究:探究极端干旱环境下植物的进化适应机制
  • 遗传分化时间估算:基于质体基因组数据推断物种分化的关键时间节点
  • 植物分类学研究:辅助Tillandsia属近缘物种的分类修订
  • 生物地理学分析:结合地理背景探讨阿塔卡马沙漠植物区系的演化过程
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 2.81 MiB
最后更新 2025年12月18日
创建于 2025年12月18日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。