蜘蛛科林蛛科全证据系统发育分析补充文件包

数据集概述

本数据集为林蛛科(Linyphiidae)全证据系统发育分析的补充文件包,包含基因序列、表型矩阵、系统发育树等核心数据文件,支持Silva-Moreira等人相关研究的复现与扩展分析。

文件详解

该数据集包含69个文件,按类型分类说明如下: - 系统发育树文件(.tre,共43个):如M4_TNT.tre、M1_MB.tre等,存储不同分析方法(TNT、RAxML、MrBayes)生成的系统发育树结果。 - NEXUS格式文件(.nex,共9个):如M1_ORIGINAL.nex、M4_ORIGINAL.nex等,可能包含原始数据矩阵或分析脚本。 - PDF文档(.pdf,共9个):如Phenotypic Matrix.pdf、Silva-Moreira et al - Supplementary File 1等,提供表型矩阵、分析结果可视化等补充信息。 - 基因序列文件(.fasta,共7个):如16S.fasta、18S.fasta、DNA_5_GENES.fasta等,存储16S、18S、H3等基因的DNA序列数据。 - 其他文件(.nwk,共1个):constrain_tree.nwk,可能为约束树文件。

适用场景

  • 系统发育研究:用于复现或验证林蛛科的全证据系统发育分析结果。
  • 分子生物学分析:基于16S、18S等基因序列数据开展序列比对、进化速率分析。
  • 形态学与分子数据整合研究:结合表型矩阵与基因数据,探索林蛛科的形态-分子进化关系。
  • 生物信息学方法验证:比较不同系统发育分析工具(TNT、RAxML等)的结果差异。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 32.86 MiB
最后更新 2025年12月16日
创建于 2025年12月16日
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