数据集概述
该数据集为猪与人间甲型流感病毒（IAV）传播研究的补充材料，包含德国135个猪场的3070份猪鼻拭子和333份人鼻拭子样本的RT-PCR检测、基因组测序数据，以及病毒突变分析结果，用于探究猪-人传播的血清学屏障机制。
文件详解
- 数据文件（CSV格式）：
- 01_Supplemental_Table_S1.csv：猪场信息及RT-qPCR检测结果汇总，字段含猪场基础信息、检测指标（1=适用，0=不适用，n.d.=未确定）
- 02_Supplemental_Table_S2.csv：人类样本信息汇总，字段定义同表S1
- 03_Supplemental_Table_S3.csv：病毒基因组突变对比数据，含MWP/21、sw-MWP/21、NRW/22毒株的HA、M2、NS1等基因片段突变情况（1=存在突变，0=无突变）
- 04_Supplemental_Table_S4.csv：研究中生成的swIAV序列在GISAID EpiFLU数据库的登录号
- 05_Supplemental_Table_S5.csv：猪IAV核蛋白（NP）序列中与人类MxA、BTN3A3抗性相关的氨基酸位点数据
- 00_Influenza-A-Virus_transmission_data_overview.csv：数据集整体概览文件
- 文档文件（PDF格式）：
- 06_Supplemental_Figure_S1.pdf：swIAV H1 HA基因系统发育树，标注本研究生成序列（红色）及人畜共患病案例序列（绿色）
- 07_Material_Methods_V2.pdf：研究材料与方法的详细说明
- 08_Questionaire_human_participants.pdf：人类参与者调查问卷
- 09_Questionaire_swine_farms.pdf：猪场调查问卷
适用场景
- 流感病毒跨物种传播机制研究：分析猪-人IAV传播的血清学屏障及病毒突变的影响
- 兽医公共卫生监测：评估猪场IAV流行情况及人间感染风险
- 病毒分子进化分析：探究swIAV适应人类宿主的基因变异特征
- 流行病学调查方法优化：基于问卷设计和样本检测流程改进跨物种传染病监测方案
