自然产物开放数据库分子注释数据集-thedevastator
数据来源:互联网公开数据
标签:自然产物,分子注释,SMILES,InChI,InChIKey,药物发现,材料科学,科研数据
数据概述:
本数据集包含了一个自然产物集合的分子注释信息,包括分子式、简化SMILES表示、InChI表示及其对应的InChIKey。该数据集为研究者提供了探索和理解复杂有机分子的机会,并有助于识别潜在的新型化合物来源,特别是在药物发现和其他应用领域。通过这个开放源数据平台,用户可以发现自然界赋予我们的各种新颖和令人兴奋的自然产物。
数据用途概述:
该数据集适用于自然产物研究、药物发现、材料科学探索等多个领域。研究人员可以利用分子式和SMILES表示来区分不同形式和结构的分子;InChI和InChIKey则提供了化学物质的一致性表示方法,有助于跨数据源和系统进行数据管理和比较。此外,数据集还支持计算科学方法,例如自动预测自然产物对生物途径的影响,分析不同自然产物混合物的效果,以及识别潜在的药物开发候选化合物。
具体字段说明:
- molecular_formula:分子式,描述了分子中每个原子的数量及其组成。
- clean_smiles:简化分子输入线条系统(SMILES)表示,通过括号表示隐式氢原子,便于计算机和数据库读取。
- inchi:国际化学标识符(InChI)表示,为化学物质提供了一种一致的表示方法,通过创建包含其结构功能组的唯一标识符。
- inchikey:国际化学标识符(InChIKey)表示,由27个字符(包括数字、大写字母和连字符)组成,是InChI的浓缩版本,便于跨独立资源进行比较。
使用建议:
如果您在研究中使用了此数据集,请引用原始作者。该数据集遵循CC0 1.0通用公共领域声明许可,您可以自由复制、修改、分发和执行此工作,即使用于商业目的,也不需要获得许可。