数据集概述
该数据集整合了来自NCBI、ENA、BV-BRC等数据库的抗生素药敏数据，每条记录对应单个样本针对特定抗生素的药敏试验结果，包含14个核心字段，为抗生素耐药性研究提供结构化数据支持。
文件详解
- 文件名称: antibiograms.tsv.zip
- 文件格式: ZIP压缩包（内含TSV文件）
- 字段映射:
- biosample: NCBI BioSample数据库样本唯一标识
- sra_biosample: NCBI SRA样本数据库标识列表（空格分隔）
- species: 样本所属物种（含亚种信息）
- antibiotic: 测试抗生素名称
- phenotype: 药敏试验表型结果
- measurement_sign: 原始结果符号（依赖检测方法）
- measurement_value: 原始结果数值（依赖检测方法）
- measurement_units: 原始结果单位
- typing_method: 药敏检测技术名称
- typing_platform: 药敏检测平台名称
- standard: 表型解释标准
- genomes: 基因组数据库标识列表（空格分隔，含GCA_、BVBRC_等前缀）
- reads: NCBI SRA测序数据运行标识列表（空格分隔）
- read_type: 测序数据类型列表（与reads字段长度一致）
- 文件名称: gn-genomes.zip
- 文件格式: ZIP压缩包
- 包含内容: 额外基因组数据及关联药敏元数据（内含metadata.xlsx文件）
数据来源
NCBI、ENA、BV-BRC
适用场景
- 抗生素耐药性模式分析: 研究不同物种对各类抗生素的耐药/敏感表型分布
- 耐药基因关联研究: 结合基因组数据探索耐药表型与基因型的对应关系
- 药敏检测方法评估: 分析不同检测技术、平台及标准对结果的影响
- 公共卫生监测: 整合多源数据监测区域或全球抗生素耐药性流行趋势
