找到6个数据集

分类: 公开数据 标签: 模拟轨迹

过滤结果

  • 测试开发模拟轨迹压缩包

    2025年12月9日 30 1 0

    数据集概述 本数据集为测试用途压缩包，包含分子动力学（MD）模拟轨迹数据。轨迹数据源自现有数据库，xtc文件缩短至1纳秒以加快下载速度，关联特定出版物，整体用于测试场景。 文件详解 文件名称: zipped.zip 文件格式: .zip（压缩文件） 内容说明: 压缩包内包含分子动力学模拟轨迹数据，其中xtc格式轨迹文件时长为1纳秒，数据源自IDP...
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  • DPPC_Berger_OPLS06_NaCl分子动力学模拟数据集

    2025年12月5日 60 83 49

    数据集概述 本数据集包含使用OPLSAA兼容的Berger-DPPC-06力场进行的、含150mM NaCl的完全水合DPPC双层膜分子动力学模拟轨迹及相关文件，模拟条件为323K、72个脂质分子、2880个SPC水分子及8个Na和Cl离子，轨迹时长120ns，分析了最后60ns数据。 文件详解 模拟配置文件：...
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  • Peter_Tieleman_DPPC_Berger_NaCl_Based_1molNaCl下DPPC双层膜MD模拟完整数据

    2025年12月6日 30 47 42

    数据集概述 该数据集包含1摩尔氯化钠（NaCl）环境下完全水合DPPC双层膜的分子动力学（MD）模拟轨迹及相关文件。采用Berger-DPPC-98力场和Gromos离子力场，模拟条件为323K、72个脂质分子、2778个SPC水分子及51对Na/Cl离子，轨迹时长120纳秒，分析使用最后60纳秒数据。 文件详解 分子动力学参数与拓扑文件：...
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  • DPPC_Berger_NaCl_scaled分子动力学模拟数据集

    2025年12月6日 30 148 89

    数据集概述 该数据集包含150mM氯化钠溶液中完全水合的DPPC双层膜的分子动力学模拟轨迹及相关文件。使用Peter Tieleman提供的Berger-DPPC-98力场与Gromacs...
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  • Gromacs_DPPC_Berger_OPLS06_NaCl_Based_盐溶液中DPPC双层膜120ns模拟完整数据

    2025年12月6日 30 18 10

    数据集概述 本数据集包含150mM NaCl溶液中完全水合DPPC双层膜的分子动力学（MD）模拟轨迹及相关文件，采用Berger-DPPC-06力场与Gromacs 4.6.7生成，离子电荷缩放系数为0.7，提供120ns模拟数据及后60ns分析结果。 文件详解 模拟轨迹文件: md.xtc: 轨迹文件，存储120ns模拟的原子坐标信息...
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  • PeterTielemanLab_DPPC_Berger_NaCl_1Mol_Based_盐环境下DPPC双层膜动力学完整数据

    2025年12月6日 30 134 102

    数据集概述 本数据集包含完全水合的DPPC双层膜在1摩尔氯化钠环境下的分子动力学模拟轨迹及相关文件，基于Berger-DPPC-98力场和Gromacs 5.0.4软件生成，离子电荷缩放系数为0.7，模拟时长120纳秒。 文件详解 分子动力学模拟文件： md.gro：GROMACS结构文件，存储模拟系统的原子坐标与拓扑信息...
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