数据集 - 海数据

nanoCAM_Gene_Based_基因表达与增强子调控完整数据

2025年12月23日 30 90 86

数据集概述本数据集包含GM12878和K562细胞系的基因相关数据，涵盖样本基础信息、GpC可及性峰位置、多向增强子统计、基因位点与表达量化整合数据及差异表达基因列表，为基因相关研究提供支持。文件详解 supplementarytable1_datasets_stat.xlsx：Excel格式，包含GM12878和K562细胞系重复样本的基础信息...

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流感疫苗反应预测的转录组原始计数数据集

2025年12月21日 30 54 11

数据集概述本数据集包含2017-2018年冈比亚儿童流感疫苗接种前（第0天）的鼻拭子和全血样本转录组数据（RNA-seq），用于支持免疫预测框架immunaut的开发，为疫苗反应预测提供基础转录组学数据支持。文件详解该数据集以压缩包形式提供，包含以下内容： - 文件名称: transcriptome_data.zip - 文件格式: ZIP压缩包...

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拟除虫菊酯杀虫剂溴氰菊酯对胃肠道神经肽及单胺信号通路影响源数据与实验方案2025

2025年12月21日 30 124 103

数据集概述本数据集为White等人2025年关于溴氰菊酯对胃肠道神经肽及单胺信号通路影响研究的配套数据，包含实验源数据、统计结果、qPCR分析数据、RNAseq相关方案及通路分析文件，支持论文图表生成与结果验证。文件详解数据统计与图表源文件：...

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IF1Ty_IF1KO_IF1Over弓形虫株RNAseq分析脚本数据集

2025年12月19日 30 123 52

数据集概述本数据集包含用于IF1Ty、IF1KO和IF1Over三种弓形虫株RNAseq分析的脚本、NGS文库质量控制文档及参考基因组文件，支持基因表达分析流程的复现与验证。文件详解文件名称: ToxoDB-65_TgondiiME49_Genome.fasta，文件格式: FASTA，内容: 弓形虫ME49株v65版本参考基因组序列文件名称:...

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环境富集对神经三维染色质互作组的年龄依赖性效应数据集

2025年12月19日 30 138 30

数据集概述本数据集包含年轻与老年小鼠海马神经元经低输入启动子捕获Hi-C（liCHi-C）及RNA-seq处理后的相关数据，用于探究年龄及环境富集对染色质互作组组织与基因表达的影响，涉及13个处理后数据文件及附加文件。文件详解说明文档：...

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临床与实验生物学转录组学研究补充数据集

2025年12月19日 30 20 11

数据集概述本数据集是《Transcriptomics for clinical and experimental biology research: hang on a seq》论文的补充资料，包含生成论文图表的R脚本、源数据文件及额外图表，支持转录组学相关研究的复现与扩展分析。文件详解该数据集包含以下文件类型及内容： - 代码文件： -...

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陆地棉双向最佳比对与OMA同源基因比较数据集

2025年12月19日 0 31 6

数据集概述本数据集为论文“Homoeolog inference methods requiring bidirectional best hits or synteny miss many pairs”的配套数据，包含陆地棉（Gossypium...

MUUMI多组学数据整合R包案例研究输入输出文件数据集

2025年12月15日 30 13 2

数据集概述本数据集包含论文《MUUMI: an R package for statistical and network-based meta-analysis for MUlti-omics data Integration》中两个案例研究的输入与输出文件，支持复现研究结果，涉及特发性肺纤维化转录组数据及THP-1巨噬细胞多组学数据的整合分析。...

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高社会性慈鲷鱼早期发育社会体验转录组特征数据集

2025年12月15日 30 164 148

数据集概述本数据集聚焦高社会性慈鲷鱼（Neolamprologus pulcher）早期发育阶段的社会体验转录组特征，通过比较有无亲代抚育的幼鱼在不同发育时间点的脑基因表达差异，探究早期社会环境对神经基因组状态、压力调节及免疫功能的影响。文件详解文件名称:...

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人类死后海马体_中额叶皮层和黑质的单核RNA测序数据集

2025年12月15日 30 182 90

数据集概述本数据集包含人类帕金森病（PD）患者及健康对照者死后海马体、中额叶皮层和黑质三个脑区的单核RNA测序数据。所有脑区样本均来自同一捐赠者，支持同一大脑内不同解剖与功能区域转录组特征的直接比较。文件详解文件名称: lee-pmdbs-sn-rnaseq_README.pdf 文件格式: PDF 文件内容:...

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心肌缺血再灌注微血管损伤自噬相关生物标志物研究原始数据集

2025年12月14日 30 5 2

数据集概述本数据集是研究“机器学习与实验验证揭示心肌缺血再灌注微血管损伤自噬相关生物标志物”的综合支撑数据，包含基于RNA-seq的生物信息学分析数据及心肌缺血再灌注损伤机制的实验验证数据。文件详解文件名称：original data.zip 文件格式：ZIP压缩包内容说明：压缩包内包含两类核心数据，一是基于RNA-...

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沙门氏菌yqiC基因与全局转录组补充信息数据集

2025年12月14日 30 39 35

数据集概述本数据集为研究论文《定殖相关基因yqiC对鼠伤寒沙门氏菌全局转录组、细胞呼吸及氧化应激的影响》的补充信息，包含22个附加文件，涵盖表格、图表及序列比对文档，支持论文核心结论的验证与拓展分析。文件详解表格文件（XLSX格式，共7个）： Table S3. RNA-seq of 117 up & 291 down...

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社会性膜翅目昆虫印记基因识别方法数据集

2025年12月14日 30 160 50

数据集概述本数据集围绕社会性膜翅目昆虫印记基因识别方法展开，包含RNA-seq数据分析流程、数字 droplet PCR验证结果及相关图表文件，为研究昆虫基因组印记提供数据支持，适用于昆虫分子生物学及基因组学分析。文件详解数据文件（CSV格式）： ASE_data_frame.csv：包含基因座、参考序列、...

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群体水平RNA_seq数据差异表达分析的处理数据集与代码

2025年12月13日 30 46 6

数据集概述该数据集包含复现两篇学术成果所需的代码与数据：一是针对两篇通信文章的回复研究（DOI:10.1186/s13059-024-03232-8），二是原始发表论文《人类群体样本分析中主流差异表达方法的假阳性夸大》（DOI:10.1186/s13059-022-02648-4）的结果及拟合优度检验资源，通过README文件提供复现指引。文件详解...

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甲壳动物肢体发育与再生基因表达动态补充数据集

2025年12月12日 30 70 60

数据集概述本数据集为《甲壳动物肢体发育与再生过程中的基因表达动态》研究论文的补充数据，包含基因表达量、聚类分析结果、序列注释等多类型文件，支持论文结论的验证与扩展分析。文件详解数据文件（CSV格式，共26个）：...

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黑腹果蝇交配后反应相关基因重分析数据集

2025年12月12日 30 78 22

数据集概述本数据集是对黑腹果蝇雌性两种组织类型交配前后基因表达数据集的重分析结果，包含4种并行分析流程的对比，识别出未被先前研究发现的交配后反应相关基因，探讨RNA-seq分析技术的优化方向。文件详解说明文档与协议文件： README.md：Markdown格式，数据集说明文档 LICENSE：无扩展名，许可协议文件图表文件（PDF格式）：...

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IF1Ty_IF1KO_IF1Over弓形虫株RNAseq分析脚本

2025年12月12日 30 207 92

数据集概述本数据集包含用于IF1Ty、IF1KO和IF1Over三种弓形虫株RNAseq分析的脚本文件、NGS测序文库质控报告及参考基因组文件，为该实验的转录组数据分析提供了完整的计算流程支持。文件详解分析脚本文件（.sh格式，共3个）： 1_mkindices_STAR_Tg_ME49_v65.sh：用于构建STAR比对索引的脚本...