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OGRDB开放的种系受体数据库_小鼠BALB_c_ByJ品系IGKV基因胚系参考数据集
数据集概述 本数据集是发布于Open Germline Receptor Database（OGRDB）的小鼠BALB/c/ByJ品系免疫球蛋白κ轻链可变区（IGKV）基因胚系参考集，包含基因序列及相关元数据，为免疫学研究提供标准化的基因参考数据。 文件详解 文件名称：licence.txt 文件格式：TXT...
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OGRDB_Based_小鼠LEWES_EiJ品系IGKV免疫球蛋白受体种系参考数据集
数据集概述 本数据集是发布于Open Germline Receptor Database（OGRDB）的小鼠LEWES/EiJ品系免疫球蛋白κ链可变区（IGKV）受体种系参考集，包含4个文件，涵盖序列数据、元信息及许可文件，为免疫遗传学研究提供标准化的种系受体序列资源。 文件详解 EiJ IGKV_rev_1.json 文件格式：JSON...
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Pythium_Comparative_Genomics_植物病原卵菌毒力策略研究数据
数据集概述 本数据集包含十三种不等鞭毛类物种（含十一种植物病原卵菌）的比较基因组学分析数据，重点研究卵菌致病相关的基因组特征，如分泌效应子、细胞壁降解酶等毒力相关基因家族的扩张与差异，揭示不同卵菌（如疫霉属、腐霉属）的毒力策略演化机制，共含十二份文件。 文件详解 文档文件（.txt格式，共6个）...
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Genomic_basis_coral_climate_resilience_研究数据
数据集概述 本数据集聚焦珊瑚对气候变化的基因组适应性机制，通过RNA-Seq技术比较热敏和耐热珊瑚的转录组基因表达差异，识别与珊瑚抗逆性相关的分子通路，包括热休克蛋白、抗氧化酶等关键基因的表达特征，为理解珊瑚应对环境胁迫的生理机制提供基础数据。 文件详解 文件名称：33496_Ahyacinthus_CoralContigs.fasta.zip...
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North_Pacific_Based_港湾鼠海豚SNP微单倍型线粒体控制区单倍型数据
数据集概述 本数据集包含北太平洋港湾鼠海豚的SNP、微单倍型基因型及线粒体控制区单倍型序列数据，覆盖加州至不列颠哥伦比亚南部沿岸及内陆水域样本。通过292个位点的多重扩增子测序（271个样本）和mtDNA序列（413个样本），揭示种群遗传结构、隔离距离模式及潜在适应性，为该近岸物种保护管理提供依据。 文件详解...
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CPR_Genome_Subset_Jaffe_et_al_2020_微生物基因组数据
数据集概述 本数据集为Jaffe et al. 2020论文相关的候选门辐射（CPR）基因组子集，内容为CPR微生物的基因组序列数据，以压缩包形式存储，可用于微生物基因组学研究。 文件详解 压缩包文件 文件名称：jaffe_et_al_cpr_genomes.zip 文件格式：ZIP 字段映射介绍：压缩包内包含与Jaffe et al....
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Triturus_Based_平衡致死系统比较基因组学研究数据_Version_1_0
数据集概述 本数据集记录了用于研究Triturus蝾螈平衡致死系统比较基因组学的生物信息学流程，包含连锁图谱、目标捕获序列、原始数据关联信息及分模块研究内容压缩包，支持对该特殊遗传系统的进化机制分析，共含4个核心文件。 文件详解 文件名称：Triturus and Lissotriton Linkage Maps.xlsx 文件格式：XLSX...
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Amplicon_sorter_Based_无参考扩增子排序与共识序列构建工具配套数据
数据集概述 本数据集为Amplicon_sorter工具的配套数据，该工具用于基于序列相似性和长度对Oxford Nanopore Technologies（ONT）测序的扩增子进行无参考排序，并构建高质量共识序列。数据集包含6个文件，支持工具的使用与验证，适用于生态学研究中扩增子测序数据的分析。 文件详解 README.txt 文件格式：TXT...
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Tympanuchus_cupido_Based_草原松鸡免疫基因选择漂变对比研究数据
数据集概述 本数据集为草原松鸡免疫基因研究数据，包含主要组织相容性复合体（MHC）等免疫受体基因与免疫介导基因的序列、基因型及种群比较数据，用于验证不同功能免疫基因在选择与遗传漂变上的差异假设，涉及9个相关文件。 文件详解 序列与基因型文件 文件名称：T. cupido MHC class II sequences alignment.fasta、T....
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Brachycephalus_Bd_GPL_Brazil_两栖动物宿主免疫反应研究数据
数据集概述 本数据集是论文“Host immune responses to enzootic and invasive pathogen lineages vary in magnitude, timing, and efficacy”的第二次发布版本，用于Zenodo存档。包含18个文件，涉及Brachycephalus pitanga暴露于Bd-...
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Dryad_Based_Tarchonantheae族分子系统发育与生物地理学研究数据
数据集概述 本数据集来自论文“Out of Africa to Madagascar - then back? Molecular phylogenetics and biogeography of tribe...
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Peromyscus_leucopus_Based_白足鼠城市与农村种群转录组资源数据
数据集概述 本数据集为白足鼠（Peromyscus leucopus）的转录组资源，包含通过454和SOLiD 5500XL平台测序组装的参考转录组、注释信息、SNP、SSR标记及基因表达差异分析结果，用于研究城市与农村种群的生态遗传分化及对城市化的进化响应，共9个文件。 文件详解 转录组序列文件...
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Siegel_Lab_Based_布氏锥虫Tb427菌株基因组组装流程数据0_0_3版
数据集概述 本数据集为布氏锥虫Lister 427菌株（Tb427）的基因组组装数据，包含0.0.3版本发布的v12和v11两个版本的基因组组装文件。v12版本提供了不同类型的组装形式（coreA、coreB、二倍体、二倍体 scaffolded），v11版本包含二倍体 scaffolded组装，所有组装文件均附带序列和注释信息。 文件详解...
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Island_Bat_Diets_Based_菲律宾岛屿蝙蝠物种饮食与栖息地关系研究数据
数据集概述 本数据集针对菲律宾宿务、保和、锡基霍尔岛的3种菊头蝠（Rhinolophus）和1种蹄蝠（Hipposideros）开展物种层面饮食分析，从77只蝙蝠粪便中识别出655个猎物分子操作分类单元（MOTUs），探究体型、回声定位频率及栖息地对蝙蝠食性分化的影响，包含16个相关文件。 文件详解 说明文档（README文件）...
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Spatio_temporal_Based_深海沉积物群落DNA和RNA宏条形码监测数据
数据集概述 本数据集为西北地中海海底峡谷及邻近斜坡区域的深海沉积物群落时空多样性监测数据，采用18S rRNA基因v7区域的真核生物标记进行宏条形码分析，包含5569个分子操作分类单元（MOTUs），主要类群为后生动物、囊泡虫和有孔虫，涉及季节和深度梯度的群落组成差异，以及DNA与RNA数据集的对比分析。 文件详解...
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Bombus_terrestris_Based_熊蜂微生物移植免疫响应与肠道菌群结构数据
数据集概述 本数据集围绕熊蜂（Bombus terrestris）微生物移植后的免疫响应与肠道菌群结构展开，通过将“抗性”和“易感”菌群移植到不同抗性背景的宿主中，研究宿主免疫系统活性与菌群抗性表型的关联，以及菌群组成差异，揭示宿主与菌群间的复杂反馈关系。 文件详解 PaperData.xlsx 文件格式：XLSX...
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Amphiporus_lactifloreus_带状蠕虫潜在新型毒素蛋白转录组分析数据集
数据集概述 本数据集为捕食性带状蠕虫Amphiporus lactifloreus的蛋白转录组分析结果，包含其潜在新型分泌毒素的相关数据。研究聚焦该蠕虫吻部表达的毒素样转录本及黏液蛋白质组中的分泌毒素成分，识别出金属蛋白酶、类海葵毒素等候选毒素，命名了两种新毒素U-nemertotoxin-1和U-nemertotoxin-2，共23个相关文件。...
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Corallorhiza_Lineage_Role_异养兰花复合群谱系与整合分类研究数据
数据集概述 本数据集为异养兰花Corallorhiza striata复合群的谱系与整合分类研究数据，包含基因组、形态、物候、繁殖模式、生态位及真菌宿主等多源数据，采用“谱系+生态角色”方法分析物种界定，涉及13个文件，覆盖序列比对、SNP数据、形态统计、开花时间等内容。 文件详解 基因组相关文件...
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Hadza_Prevotella_Based基因组组装与CAZy预测完整研究数据2023
数据集概述 本数据集包含Gellman et al. 2023年研究中Hadza Prevotella的基因组组装、注释及CAZy（碳水化合物活性酶）预测结果，涉及相关菌株（如Pcopri、Btheta、Buniformis）的基因组支架、基因注释文件、CAZy酶分类数据及分析代码，共47个文件，用于支持饮食来源碳水化合物对肠道菌群定植影响的研究。...
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Nesotrochidae_Based_新世界洞穴秧鸡新科命名线粒体基因组与系统发育数据
数据集概述 本数据集为Nesotrochidae新科命名相关研究的配套数据，包含两种鸟类（马达加斯加林秧鸡、福布斯林秧鸡）的线粒体基因组组装数据、11个线粒体基因的串联编码序列比对数据，以及基于BEAST2的系统发育分析输入输出文件，用于支持新世界洞穴秧鸡与新西兰adzebills亲缘关系的研究。 文件详解...
