BFR2_策划的底栖有孔虫核糖体参考数据库

数据集概述

本数据集为底栖有孔虫核糖体参考数据库(BFR2),包含5,324条底栖有孔虫18S rDNA参考序列及对应的元数据。数据覆盖分类学信息、采样详情、序列来源等内容,是研究底栖有孔虫分类与分布的标准化参考资源,总计包含3个文件。

文件详解

  • 序列文件
  • 文件名称:BFR2_v1.2_full_sequence.fasta
  • 文件格式:FASTA
  • 字段映射介绍:包含5,324条底栖有孔虫18S rDNA参考序列,每条序列对应唯一标识信息
  • 元数据文件
  • 文件名称:BFR2_v1.2_metadata.tsv
  • 文件格式:TSV
  • 字段映射介绍:包含BFR2编号、序列长度、分类学信息(纲、目/亚目/分支、科、属、种)、分离株编号、克隆/直接测序标识、GenBank登录号、采样地点、经纬度(十进制)、采集日期、采集人、关联出版物、期刊、第一作者、分类学备注、采样备注等字段
  • 表格文件
  • 文件名称:BFR2_v1.2_23092024.xlsx
  • 文件格式:XLSX
  • 字段映射介绍:包含与TSV文件一致的元数据内容,以表格形式呈现便于查看与编辑

适用场景

  • 底栖有孔虫分类学研究:利用分类学字段进行物种鉴定与系统发育分析
  • 海洋生物多样性调查:结合采样地点与经纬度数据,分析底栖有孔虫的地理分布特征
  • 分子生态学研究:通过核糖体序列探讨底栖有孔虫的遗传多样性与进化关系
  • 参考数据库构建:作为标准化的核糖体序列资源,支持相关生物信息学工具的开发与验证
  • 环境监测应用:基于采样数据与分类信息,评估海洋环境变化对底栖有孔虫群落的影响
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数据与资源

该数据集没有数据

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 0.0 MiB
最后更新 2026年2月1日
创建于 2026年2月1日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。