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PHYLOGENIES_水生群体无脊椎动物繁殖策略进化系统发育数据
数据集概述 本数据集围绕水生群体无脊椎动物繁殖策略的进化转变展开,包含基因序列比对文件、系统发育树拓扑结构文件、祖先特征估计脚本及繁殖策略编码数据。通过多模型分析不同基因分区的系统发育关系,为研究该类群繁殖策略的进化提供支撑,共含17份文件。 文件详解 基因比对文件 文件名称:All_genes_alignment.nex 文件格式:NEX...
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Hyla_andersonii_Based基因组系统地理学研究数据
数据集概述 本数据集为北美东部特有物种Pine Barrens Treefrog(Hyla andersonii)的基因组系统地理学研究数据,包含该物种三个地理种群(阿拉巴马/佛罗里达、卡罗莱纳、新泽西)的基因组分析相关文件,支持研究其历史分布碎片化的成因、种群分化时间及冰期避难所等进化历史问题。 文件详解 文档文件...
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Carebara_Morphology_and_NGS蚂蚁物种研究数据
数据集概述 本数据集支持非洲Carebara属蚂蚁物种的分类研究,包含两种新物种(Carebara phragmotica sp. n.和Carebara lilith sp. n.)的形态学与下一代测序数据,解决了该属蚂蚁品级关联问题,涉及肯尼亚Kakamega森林及科特迪瓦的样本分析。 文件详解...
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海伦科尼斯增强型蝴蝶翅膀图案的进化基因数据
数据集概述 本数据集围绕亚马逊Heliconius蝴蝶复杂翅膀图案的进化起源展开,包含142个个体(涉及17个物种)的基因组序列数据,聚焦与dennis和ray两种红色图案元素相关的非编码序列调控模块,通过系统发育分析揭示其进化历史及重组机制,为研究形态创新的遗传基础提供支持。 文件详解 压缩文件...
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nrpb2_替代分子标记环境真菌群落分析数据
数据集概述 本数据集围绕rpb2基因作为环境真菌群落分析替代分子标记展开,对比其与ITS标记在云杉林表层土壤真菌群落分析中的适用性。包含模拟群落数据、OTU表及系统发育树数据,支持评估rpb2基因在分类覆盖、定量准确性和系统发育分析中的优势,共6个文件。 文件详解 模拟群落序列文件 文件名称:MOCK_ITS.fas、MOCK_rpb2.fas...
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真兽类体型演化_系统发育定年方法影响研究数据
数据集概述 本数据集围绕白垩纪-古近纪真兽类体型演化展开,研究系统发育定年方法对性状演化解读的影响。通过将体型演化模型拟合到不同定年方法构建的系统发育树上,比较传统古生物学定年、贝叶斯化石生灭法等不同方法对演化模型推断的作用,共包含5个文件。 文件详解 File S1.xlsx 文件格式:XLSX...
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螃蟹蜘蛛的颜色与伏击地点的关联性演化研究数据
数据集概述 本数据集围绕蟹蛛体色与伏击位点的协同进化研究,包含1149个标本(66种,来自澳大利亚和欧洲)的反射率测量数据、系统发育树数据、标本信息及补充表格等,用于验证花栖习性与UV+-白色体色的关联假设,支持进化生物学分析。 文件详解 数据文件(CSV格式)...
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Cichlid_丽鱼起源化石与分子证据研究数据
数据集概述 本数据集围绕丽鱼起源时间展开研究,提供了古生物学和分子钟分析的相关数据。通过整合化石证据与10个核基因的DNA序列数据集,对丽鱼冠群起源时间进行估算,结果支持其起源于古新世(约65-57百万年前),晚于冈瓦纳大陆分裂时间,为丽鱼生物地理学研究提供了修订的宏观进化时间尺度。 文件详解 数据文件 文件名称:cichlidCONCAT.nex...
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加州南部河流流域三刺鱼的进化与分布历史研究数据
数据集概述 本数据集聚焦加州南部圣克拉拉河与文图拉河流域三刺鱼的进化历史与景观遗传学特征,通过线粒体序列和微卫星数据,分析无鳞甲种群的遗传结构、地理分布边界及与扩散障碍的关联性,揭示流域内种群分化模式及外来基因渗入对原生种群的影响,为濒危种群保护提供科学依据。 文件详解 文件名称:README_for_Richmond et al...
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Allium_野生洋葱染色体数目演化研究数据集
数据集概述 本数据集围绕野生洋葱(Allium属,石蒜科)的染色体数目演化展开研究,涵盖分子系统发育分析、染色体数目变化模型推断等核心内容,包含系统发育重建用序列文件、染色体演化分析控制文件、附录文档及补充图表等18个文件,为植物多倍体演化机制研究提供支撑。 文件详解 文档类文件...
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系统发育推断_地理分布演化及物种多样性研究数据
数据集概述 本数据集包含地理范围演化与物种分化相互作用的系统发育推断研究相关文件,涉及物种地理分布特征与谱系形成、灭绝过程的相互影响分析。数据支持新似然法模型的验证与应用,包含模拟测试及加州植物群落栖息地占据演化的分析文件,共11个文件。 文件详解 数据文件 文件名称:arc-states.csv、cea-states.csv 文件格式:CSV...
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系统地理学_印度灵猫_生物地理学_起源研究_数据
数据集概述 本数据集聚焦小灵猫(Viverricula indica)的系统地理学研究,通过线粒体基因组和细胞色素b+控制区测序分析89个历史与现代样本,探究其原生分布区的演化历史及西印度洋岛屿引入种群的起源,为物种分类和生物地理动态研究提供数据支持。 文件详解 文件名称:Gaubert_SupMat_Table S1.xlsx 文件格式:XLSX...
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西地中海Cymbalaria植物谱系地理研究数据
数据集概述 本数据集围绕西地中海Cymbalaria植物(车前科)的谱系地理研究构建,整合AFLP指纹、质体DNA序列及形态测量数据,探究其起源、扩散事件及分类学界限,涉及科西嘉-撒丁岛共同起源与两次独立长距离扩散,共包含5个文件。 文件详解 质体DNA序列文件: 文件名称:cp.fas 文件格式:FAS...
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非鸟翼类兽脚亚目恐龙鳞片皮肤结构数据2022_01
数据集概述 本数据集聚焦非鸟翼类兽脚亚目恐龙的非羽毛皮肤结构,涵盖鳞片、真皮骨化结构等形态与分布特征。数据基于化石记录,对比不同类群(如角鼻龙类、异特龙超科、暴龙超科等)的皮肤类型差异,为研究恐龙皮肤演化及与羽毛的共存关系提供基础信息。 文件详解 字符映射文件(.nex格式)...
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非洲裸鳃类动物的生殖多样性演化及比较系统发育分析数据
数据集概述 本数据集围绕非洲Afrobatrachia蛙类支系的繁殖多样性进化展开,包含系统发育比较分析相关的序列文件、模拟数据、功率分析结果及脚本。通过研究该类群(占非洲蛙类多样性超一半)的繁殖模式演化,探讨陆生化繁殖策略的中间阶段、生态形态与产卵位点的关联等科学问题,共含9个文件。 文件详解 序列文件...
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千花藤的核基因系谱研究_中美洲云雾林的植物分类学分析
数据集概述 本数据集为墨西哥手树(Chiranthodendron pentadactylon)的核系统地理学研究数据,包含基于RAD测序的核DNA序列分析及生态位建模结果,涉及墨西哥和危地马拉种群的遗传结构、分化时间、 demographic趋势等信息,支持对该物种第四纪演化历史及云林片段化影响的研究。 文件详解...
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Thirty_clues_被子植物异常多样化研究数据
数据集概述 本数据集围绕被子植物异常多样化这一核心主题,包含支撑相关研究的关键文件,涉及贝叶斯分析文件、化石校准文档及分子数据文件,为探究被子植物成为宏观真核生物中高度多样化类群的机制提供数据支持,共包含3个文件。 文件详解 BAMM_files.zip 文件格式:ZIP...
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Sulawesi_Based生物地理学区系起源分析数据
数据集概述 本数据集为苏拉威西岛生物地理学研究相关数据,聚焦该岛特有动物区系的起源争议,通过带时间校准的系统发育树与地质约束条件,对比分析隔离分化与扩散在区系形成中的作用。数据支持多数类群为扩散起源,约两成类群无法排除隔离分化可能,为苏拉威西岛生物地理演化研究提供基础数据。 文件详解 文件名称:BEAST nex files.zip...
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澳大利亚与新几内亚彩虹鱼的系统发育与生物地理学研究数据
数据集概述 本数据集为澳大利亚与新几内亚彩虹鱼(Melanotaeniidae科)的系统发育与生物地理学研究数据,包含7个线粒体蛋白编码基因及核S7基因前两个内含子的测序数据(共6827个碱基对),通过系统发育分析探究该科鱼类的演化关系、生物地理历史、物种分化时间及基因渐渗事件,同时发现近20个未描述物种。数据集含3个文件。 文件详解...
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Micrarchus_低温胁迫转录响应与遗传结构研究数据
数据集概述 本数据集围绕新西兰竹节虫属(Micrarchus)开展,包含高山与低地物种对低温胁迫的转录响应及种群遗传结构数据。通过RNA-Seq、qPCR技术分析低温诱导的差异表达基因,结合线粒体DNA、核糖体DNA及SNP数据探究种群遗传背景对基因表达的影响,揭示低温适应的分子机制与种群分化特征。 文件详解 转录组注释文件...



