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Julou_2020_Based_大肠杆菌乳糖操纵子诱导单细胞实验数据
数据集概述 本数据集包含大肠杆菌在葡萄糖与乳糖交替作为碳源时，乳糖操纵子诱导的单细胞实验原始数据。数据来自36组独立实验，通过相差显微镜和落射荧光显微镜监测细胞生长及乳糖操纵子表达情况，支持微生物基因表达调控机制的研究。 文件详解 Julou_2020_lacInduction_assays.xlsx 文件格式：XLSX...
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ASD_DB_Source_新型FAD依赖单加氧酶代谢降解研究补充数据
数据集概述 本数据集为论文“新型FAD依赖单加氧酶对乙酰丁香酮的分解代谢及2,4,6-三氯苯酚的共代谢降解”的补充数据，包含实验筛选、单化合物降解、菌株代谢、诱导实验、基因数据库、质谱检测等相关文件，对应论文中的多个图表及补充材料，总计8个文件。 文件详解 screening_rca_data.csv（CSV格式）：细菌 consortium...
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DRYAD_Based_大肠杆菌功能基因型与宿主内及种群丰度关联研究数据
数据集概述 本数据集围绕共生大肠杆菌功能基因型展开，探究其在宿主个体内和种群中的丰度关联。研究以54只成年山地帚尾袋貂为对象，分析34个基因定义的功能基因型与宿主内、种群丰度的关系，发现菌株在个体内相对丰度与种群丰度正相关，且两组丰度均与8个功能基因（agn43等）相关。 文件详解 文件名称：Data for DRYAD.xlsx 文件格式：XLSX...
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Pfeifer_Source_猪舍高优先级抗生素耐药大肠杆菌研究补充材料
数据集概述 本数据集是论文《猪舍中对最高优先级关键重要氟喹诺酮类或第三代、第四代头孢菌素类抗生素耐药的大肠杆菌持续存在》的补充材料，包含11个文件，涉及猪场管理数据、细菌耐药性统计、抗生素使用情况及相关图表，用于支撑猪舍耐药大肠杆菌的研究结论。 文件详解 图片文件（.tiff格式，共5个）...
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Auxotrophy_Based_细菌生物合成基因丢失选择性优势研究数据
数据集概述 本数据集围绕细菌生物合成基因丢失的进化机制展开，包含949个代谢网络分析及大肠杆菌、贝氏不动杆菌20个营养缺陷型突变体与野生型的竞争实验原始数据，旨在揭示营养丰富环境中细菌基因组简化的适应性优势。 文件详解 文件名称：Selective_benefits_auxotrophy_raw_data.zip 文件格式：ZIP...
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Host_Seeking_Data_蚊子觅食行为与疟原虫感染关系研究数据
数据集概述 本数据集围绕疟原虫是否主动操纵蚊子觅食行为展开研究，分析不同感染阶段（早期卵囊期、晚期子孢子期）及免疫刺激对蚊子宿主吸引力、嗅觉受体响应的影响，包含行为学与神经生理学相关数据，共4个文件。 文件详解 文档文件（2个） 文件名称：README_for_Host_Seeking Data.doc 文件格式：DOC...
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Burmeister_2016_Based_病毒宿主协同进化适应景观数据
数据集概述 本数据集围绕宿主协同进化如何改变病毒适应景观展开，聚焦λ噬菌体进化出利用大肠杆菌OmpF受体新能力的过程。包含6种独立过渡期间分离的λ噬菌体中间基因型及其祖先的相关数据，用于分析宿主抗性进化对病毒适应性路径的影响，共含1个文件。 文件详解 文件名称：Burmeister_2016_Dryad_Data_Scripts.zip...
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Leapfrog_Based_噬菌体与大肠杆菌协同进化跃迁动力学研究数据
数据集概述 本数据集通过噬菌体λ与大肠杆菌协同进化种群的表型和基因组分析，探究病毒-宿主协同进化的跃迁动力学。数据包含感染表型与基因组测序的联合分析结果，揭示了表型符合军备竞赛动力学（ARD）、基因组呈现波动选择动力学（FSD）的混合“跃迁”动态，共5个文件。 文件详解 README.txt 文件格式：TXT...
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Escherichia_coli_Based大肠杆菌基因产物分配原始数据
数据集概述 本数据集包含大肠杆菌母细胞年龄对基因产物分配影响的实验原始数据，涉及绿色荧光蛋白表达水平与子细胞生长速率的相关性分析，验证基因产物分配的不对称性及母细胞年龄对后代不对称性的影响。 文件详解 文件名称：Raw_data_for_figure_3a._Supplemental_material.xlsx 文件格式：XLSX...
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Dryad_Based_大肠杆菌与腐败微生物混合生物膜消毒剂效果研究数据集
数据集概述 本数据集围绕大肠杆菌（STEC）与腐败微生物形成的混合生物膜对消毒剂的耐受性展开研究，包含不同温度、微生物组合及消毒剂类型下的实验数据。记录了单菌种/多菌种生物膜、浮游菌对多种消毒剂的最小杀菌浓度（MBC）和生物膜清除浓度（BEC），以及不同菌株的耐药性差异，共5个文件。 文件详解 README.md 文件格式：MD...
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IMS_Based_基于移动电子鼻的尿路感染病原体快速检测原理验证研究数据
数据集概述 本数据集来自基于离子迁移谱（IMS）的移动电子鼻检测尿路感染（UTI）病原体的原理验证研究，包含101份培养样本数据，涉及大肠杆菌、腐生葡萄球菌等4种常见UTI细菌及无菌培养板样本，用于验证电子鼻对UTI病原体的快速鉴别能力。 文件详解 文件名称：PLOS ONE DATA.zip 文件格式：ZIP...
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orderedPainting_Based_细菌基因组重组热区高效推断数据
数据集概述 本数据集为细菌基因组重组热区推断研究相关数据，基于有序染色算法开发的计算高效方法，识别细菌基因组中DNA频繁转移的“热区”。数据支持分析大肠杆菌和空肠弯曲菌基因组的重组事件，为空肠弯曲菌200个基因组分析结果，可用于原核生物群体基因组重组研究。 文件详解 文件名称：jejuni200_data.zip 文件格式：ZIP...
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DeepBacs_Based_混合细菌细胞分割数据集与StarDist模型
数据集概述 本数据集包含金黄色葡萄球菌（S. aureus）、大肠杆菌（E. coli）和枯草芽孢杆菌（B. subtilis）的混合训练与测试图像，以及用于细胞分割的StarDist模型。图像类型涵盖明场、荧光和分割掩膜，适用于微生物细胞图像分割的模型训练与验证。 文件详解...
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Great_Lakes_Source_城市水体污水污染与微生物风险监测数据
数据集概述 本数据集包含美国威斯康星州密尔沃基市未经处理的污水（污水处理厂进水）样本及五大湖河口水样，采集周期为两年。样本通过qPCR检测人类相关指示菌（人类拟杆菌、人类毛螺菌科）及大肠杆菌、肠球菌，河口水样还通过自动化高频采样分析微生物指标，共包含一个文件。 文件详解 文件名称：final data for...
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pB15_Plasmid_Evolution_抗生素抗性与传播相关性实验数据
数据集概述 本数据集为大肠杆菌质粒pB15进化实验的结果数据，记录了实验室进化过程中质粒四环素抗性水平与垂直/水平传播率的关联变化，包含4个实验数据文件，涉及接合率、抗生素最小抑制浓度、碳源利用适应性等核心指标，用于分析质粒表型分化及抗性与传播的相关性机制。 文件详解 文件名称：Conjugation rates.xls 文件格式：XLS...
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BeONE_Project_Escherichia_coli基因组组装数据集
数据集概述 本数据集包含BeONE Consortium收集的308株大肠杆菌样本的基因组组装数据，以及来自ENA或NCBI SRA的1999株大肠杆菌公开基因组组装补充数据。数据经标准化处理，包含组装统计信息、基因分型及样本元数据，支持大肠杆菌的基因组学研究与分析。 文件详解 BeONE_Ec_metadata.xlsx 文件格式：XLSX...
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应激条件下大肠杆菌中聚集体对mRNA的保护作用实验完整数据_20250625
数据集概述 本数据集为论文“Aggresomes protect mRNA under stress in Escherichia coli”配套的完整源数据，包含一份Excel文件。数据记录了大肠杆菌在应激条件下聚集体（Aggresomes）对mRNA的保护作用相关实验结果，是研究微生物应激响应中基因表达调控机制的关键支撑数据。 文件详解...
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ABHD2_Recombinant_Based_大肠杆菌重组表达纯化实验数据
数据集概述 本数据集记录ABHD2蛋白（α/β水解酶结构域蛋白2）的大肠杆菌重组表达与纯化实验内容。ABHD2是代谢丝氨酸水解酶超家族成员、孕酮膜受体，参与精子CatSper激活与超活化；实验针对其33-435位氨基酸片段进行重组表达纯化，为首次获得活性重组蛋白的相关记录。 文件详解 文件名称：ABHD2 Purification nickel +...
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Test_Synergistic_Based细菌有害突变协同互作实验原始数据
数据集概述 本数据集为细菌有害突变协同互作测试的原始数据，包含225个携带一至三个连续突变的大肠杆菌基因型，以及27个重组基因型的适应性测量结果。数据用于验证突变确定性假说，探究有害突变间的协同或拮抗互作关系，共包含两个文件。 文件详解 文件名称：Raw data for Figure 2.xlsx 文件格式：XLSX...
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bacterial_colonies_Based_细菌菌落时空遗传模式实验数据
数据集概述 本数据集为群体遗传学定量验证研究的实验数据，包含大肠杆菌和铜绿假单胞菌两种细菌的菌落生物膜时空遗传模式数据。通过分析、模拟与实验结合，验证群体遗传学空间模型对微生物进化的定量描述能力，支持遗传多样性、细胞迁移等参数的预测与估算。 文件详解 README_for_submitted_data.txt 文件格式：TXT...
