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补充材料1_ZooKeys_中国淡水涡虫新物种PCR引物序列数据_2025
数据集概述 本数据集为论文《中国南部海南岛和雷州半岛的两种淡水涡虫新物种》的补充材料1，包含用于PCR扩增的引物序列信息，是研究淡水涡虫新物种分子鉴定的关键实验数据，支持淡水涡虫分类学与系统发育分析。 文件详解 文件名称：oo_1296563.docx 文件格式：DOCX...
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Prochlorococcus_Based_海洋蓝细菌多样分离株基因组数据
数据集概述 本数据集包含27株海洋蓝细菌Prochlorococcus的全基因组序列（2株完整闭合，25株草稿质量），覆盖5个主要系统发育分支，分离自全球不同海域。同时提供预计算的蛋白质直系同源组（COGs）聚类数据，可用于比较基因组学研究，是微生物生态学、进化和海洋学领域的重要参考资料。 文件详解 文档文件（document_files）...
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Neobatrachia_Based_新蛙类线粒体与核基因分子进化速率数据
数据集概述 本数据集包含新蛙类（Neobatrachia）及其近缘类群的线粒体全基因组与核基因序列数据，用于研究新蛙类起源过程中分子进化速率的变化。数据涵盖6种蛙类（含1种非新蛙类）的序列，支持构建系统发育树、分析线粒体与核基因替代速率差异及选择压力变化。 文件详解...
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GenBank_Magnoliopsida_ASV系统发育构建参考序列数据
数据集概述 本数据集为论文补充材料4，包含从GenBank下载的参考序列，用于构建Magnoliopsida类群的ASV系统发育树。数据支撑海洋真核生物DNA测序在生物多样性调查中的应用研究，共包含一个文件。 文件详解 文件名称：oo_1375191.xlsx 文件格式：XLSX...
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Passerida_Based_鸟类线粒体基因组转录组测序系统发育研究数据
数据集概述 本数据集通过转录组测序获取四种雀形目Passerida鸟类的线粒体基因组蛋白编码基因序列，用于研究Passerida基部类群的系统发育关系，提出Sylvioidea与Passeroidea为姐妹群、Paridae和Muscicapidae依次为其外类群的新假设，验证转录组测序获取线粒体基因组的有效性。 文件详解...
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FMR1_Iso_Seq_Based_脆性X相关疾病基因剪接异构体研究数据
数据集概述 本数据集为FMR1基因Iso-Seq测序的最终文件，包含49种FMR1基因剪接异构体的序列、表达量、开放阅读框比对等信息。数据来自对脆性X前突变携带者的研究，旨在分析FMR1基因剪接变异的表达模式及其与脆性X相关震颤/共济失调综合征（FXTAS）等疾病的关联。 文件详解 FMR1.49_isoforms.ORF_alignment.txt...
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Spider_Probe_Kit_Based蜘蛛锚定杂交富集系统发育研究数据
数据集概述 本数据集为蜘蛛系统发育研究的锚定杂交富集（AHE）数据，包含针对蜘蛛三个分类深度的基因座和系统发育树文件：深层蜘蛛科间关系（33个类群）、捕鸟蛛科内属种关系（25个类群）及北美捕鸟蛛属种关系（83个类群）。数据集共9个文件，用于解析蜘蛛系统发育树的深层与浅层进化关系，支持分类学研究及宏观进化假说验证。 文件详解 基因座压缩文件（Loci...
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OGRDB_Based_小鼠C57BL_6J_IGLV免疫受体种系参考数据集
数据集概述 本数据集为小鼠C57BL/6J品系的IGLV免疫受体种系参考数据，发布于开放种系受体数据库（OGRDB）。包含未带间隙、带间隙的FASTA序列文件、JSON格式数据文件及许可证文件，共4个文件，覆盖免疫受体种系序列的核心信息，是免疫遗传学研究的基础参考资料。 文件详解 未带间隙序列文件：6J...
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MycoPins_Source_真菌定植监测实验引物与ITS2片段数据2023
数据集概述 本数据集为MycoPins实验的补充材料，包含实验所用引物序列及从木针锯末DNA中扩增的ITS2片段序列，用于监测细木质残体的真菌定植情况。数据集仅含一个文档文件，是相关分子生物学实验的核心序列参考资料。 文件详解 文件名称：oo_827823.docx 文件格式：DOCX...
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Pearl_millet_Based_珍珠粟驯化历史与早_晚花品种分化研究数据
数据集概述 本数据集围绕珍珠粟（Pennisetum glaucum）的驯化历史及早、晚花品种分化展开研究，包含2个压缩文件。通过18个微卫星位点和8个核苷酸序列分析其遗传多样性与群体结构，探讨野生与栽培种的基因交流及驯化起源场景，为理解珍珠粟驯化过程提供数据支持。 文件详解 多态性数据文件 文件名称：Polymorphism_data.zip...
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Neottia_ovata_Based陆地兰科植物种群动态与菌根多样性研究数据
数据集概述 本数据集围绕陆地兰科植物Neottia ovata的9个种群展开，包含2003-2013年种群大小变化、种子萌发实验结果及菌根真菌多样性数据。通过对比种群动态与菌根真菌群落组成、土壤条件的关系，探究兰科植物依赖菌根共生的种群更新机制，共含4个相关文件。 文件详解 种群数据文件 文件名称：Population data.xlsx...
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Dryad_Source_Attwater草原鸡免疫基因与生存相关性研究数据集
数据集概述 本数据集来自对极度濒危的Attwater草原鸡的研究，探讨免疫基因特定等位基因而非全基因组杂合性与免疫反应及生存的关系。包含9个文件，涵盖免疫基因分析数据、生存分析输入数据、基因序列文件及分析说明文档，支持对濒危物种免疫适应性和生存机制的研究。 文件详解 数据文件（.xlsx/.csv/.fna）...
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OGRDB_打开小鼠种系基因组数据库_BALB_c小鼠IGH受体种系参考数据集
数据集概述 本数据集为小鼠BALB/c亚群的IGH受体种系参考集，由Open Germline Receptor Database（OGRDB）发布。包含IGH受体基因的种系序列数据及相关说明文件，共4个文件，支持免疫遗传学领域对小鼠BALB/c亚群IGH受体基因的研究与分析。 文件详解 许可文件： 文件名称：licence.txt 文件格式：TXT...
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miR156b_c_d_Vv_SPL9_葡萄全生长阶段表达模式及切割作用研究数据
数据集概述 本数据集围绕葡萄品种“Takatsuma”中miR156b/c/d及其靶基因Vv-SPL9展开，包含二者在18种葡萄组织中的表达模式、互作验证结果及切割作用的时空变化数据，为研究葡萄生长发育中miRNA介导的调控机制提供支持。 文件详解 文件名称：List of miR156b,c,d sequences.docx 文件格式：DOCX...
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RNA_Editing_Based苔藓植物细胞器基因编辑位点与PPR蛋白关联研究数据
数据集概述 本数据集包含42种苔藓植物的细胞器基因RNA编辑位点及核编码PPR蛋白序列数据，涵盖31种非地钱类苔藓植物的128个细胞器基因中7428个RNA编辑位点，以及25059条PPR蛋白序列。数据可用于研究RNA编辑位点数量与GC含量、核PPR蛋白多样性的关联，是探索植物RNA编辑进化机制的基础数据。 文件详解 模型文件（org-nt-...
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PoAstVs_GenBank_Based_东非小型猪场猪星状病毒基因组分析补充数据
数据集概述 本数据集为东非小型猪场猪星状病毒研究的补充材料，包含5个表格，记录猪星状病毒全基因组及衣壳蛋白（ORF2）的核苷酸、氨基酸序列比对结果、进化分歧估计和潜在抗原表位预测，用于揭示东非流行的新型遗传多样性基因型，支持病毒基因组学研究。 文件详解...
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Molecular_evolution_Based_神经嵴调控网络分子进化研究数据
数据集概述 本数据集聚焦硬骨鱼类神经嵴调控网络（NC GRN）的分子进化研究，包含36个基因在16种硬骨鱼类中的分子分化模式分析数据。研究通过dN/dS比率分析揭示不同发育阶段基因的选择压力差异，支持发育沙漏模型；通过序列特征聚类验证网络基因的极端保守性，为理解脊椎动物形态多样性的分子机制提供数据支撑。 文件详解 文件名称：Alignments.zip...
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ZooKeys_补充材料_2_苏门答腊云林蜥蜴系统发育评估样本及GenBank数据
数据集概述 本数据集为论文补充材料2，包含用于Sumatra云林Dendragama属蜥蜴系统发育评估的标本信息及对应GenBank登录号，支持该属蜥蜴的系统发育关系与生物地理学研究，共1个文件。 文件详解 文件名称：oo_476877.xlsx 文件格式：XLSX...
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Eriophyoidea_Based_植食性瘿螨类高级系统发育与线粒体基因组研究数据
数据集概述 本数据集围绕植食性瘿螨类（Eriophyoidea）的高级系统发育研究展开，包含153种瘿螨的完整线粒体基因组测序结果，涉及54种线粒体基因重排模式。数据支持瘿螨类整体及内部6个分支的单系性，结合分子定年揭示其起源于三叠纪、白垩纪多样化的特征，与被子植物演化相关。 文件详解 README.txt 文件格式：TXT...
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Jauhal_et_al_Mol_Ecol_基于须鲸与外类群的嗅觉受体基因进化评估数据
数据集概述 本数据集围绕须鲸嗅觉受体基因进化评估展开，包含从须鲸及陆生外类群物种中挖掘的嗅觉受体基因序列、系统发育树文件、分析代码及结果可视化文件，共8个文件，支持基因进化相关研究的复现与分析。 文件详解 压缩包文件...
