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PyroClean_Based_蛋白质编码扩增子焦磷酸测序去噪数据集
数据集概述 本数据集是PyroClean项目相关的数据,包含用于蛋白质编码扩增子焦磷酸测序去噪的数据,旨在恢复种间和种内遗传变异。数据集仅有一个压缩文件,未区分训练/测试、数据/标签或原始/处理数据,无额外说明文档或内容预览。 文件详解 文件名称:Datasets.zip 文件格式:ZIP...
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easyMF_Based_基于矩阵分解的生物发现转录组数据分析平台数据
数据集概述 本数据集为easyMF平台相关数据,easyMF是一个用户友好的网络平台,通过矩阵分解技术从大规模转录组数据中促进生物发现,支持从原始测序读到基因表达的分析流程,可将基因表达矩阵分解为元基因,并提供基于元基因的探索性分析模块,数据包含九个Excel文件。 文件详解 文件名称:Table S1.xlsx、Table S2.xlsx、Table...
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Synbranchiformes_Based全球扩散生物地理学研究数据
数据集概述 本数据集包含合鳃鱼目(Synbranchiformes)鱼类的超保守元件(UCEs)测序数据及系统发育分析结果,用于研究该类群的全球扩散历史与生物地理学模式。数据支持东南亚为主要类群祖先区域的结论,排除冈瓦纳大陆分裂假说,揭示独立大陆入侵事件,共包含十五个文件。 文件详解 系统发育树文件(.tre)...
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CUT_RUN_myProtein_Based蛋白质降解实验样本数据
数据集概述 本数据集包含蛋白质2降解后myProtein 1-3的CUT&RUN样本数据,涵盖阴性对照、阳性对照及测序标识符信息,为相关蛋白质实验研究提供结构化数据支持。 文件详解 文件名称:Data Dictionary_CUT&RUNsamples.xlsx 文件格式:XLSX...
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Murina_gracilis_姐妹种_台湾特有蝙蝠物种分化研究数据
数据集概述 本数据集围绕台湾特有蝙蝠疑似姐妹种Murina gracilis和M. recondita的物种分化过程展开,包含线粒体DNA、微卫星数据及相关测序数据,用于检验非异域分化与基因流情况,揭示核DNA与线粒体DNA冲突背后的物种演化历史。 文件详解 mu4pop.u 文件格式:.u...
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PhytoKeys_补充材料1_海京科属系统基因组学研究补充材料数据
数据集概述 本数据集为Heliconia属系统基因组学研究的补充材料,包含系统基因组学分析所需的标本信息、基因组序列数据及登录号。数据支撑对热带Heliconia属的分类学研究,共含一个文件,是该属分类修订与系统发育分析的重要参考资料。 文件详解 文件名称:oo_1218765.xlsx 文件格式:XLSX...
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suecharo_yevis_demo_Based_工作流文件数据集
数据集概述 本数据集是suecharo/yevis-demo中的一个工作流文件集合,包含8个文件,涵盖配置文件、压缩数据文件、文档文件等5种类型,主要用于生物信息学分析流程的定义与执行,无目录层级结构。 文件详解 配置与元数据文件 文件名称:yevis-metadata-1.0.0.yml 文件格式:YML 字段映射介绍:工作流元数据配置文件...
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Metabarcoding_Based_生物多样性监测技术验证数据集
数据集概述 本数据集为宏条形码技术验证数据,通过对比马来西亚、中国、英国三地高质量标准数据集(含55,813个节肢动物和鸟类标本),验证宏条形码在生物多样性监测中的可靠性、可验证性及效率。数据集包含15个文件,涵盖实验结果、测序数据、映射文件及代码脚本等,支持生物多样性分析与保护应用。 文件详解 文档文件(.txt,共10个)...
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图鲁宁_补充材料_2_溪流大型无脊椎动物群落生物评估补充数据_2021
数据集概述 本数据集为论文补充材料2,聚焦溪流大型无脊椎动物群落的生物评估与生物多样性调查。通过宏条形码技术分析溪流生物群落,为相关研究提供标准化数据支持,共包含一个文件。 文件详解 文件名称:oo_571665.xlsx 文件格式:XLSX...
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Xenopus_laevis_Based_非洲爪蟾泛非系统地理学研究数据
数据集概述 本数据集为非洲爪蟾(Xenopus laevis)泛非系统地理学研究的分子变异分析数据,包含17个基因座(1个线粒体、16个核基因)的测序及分析文件,涉及159个样本。数据用于探究该物种的系统发育关系、种群结构及进化历史,支持物种分类修订及分布范围重新划分。 文件详解...
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Inga_Targeted_Enrichment_核基因系统发育研究数据
数据集概述 本数据集为 Inga 属(豆科含羞草亚科)系统发育研究的靶向富集核基因数据,包含通过转录组筛选的264个核基因座的测序结果,经质控后保留194个基因座的25.9万余碱基序列,涉及22种 Inga 物种及外类群,用于提升新热带雨林 Inga 属物种辐射的系统发育分辨率。 文件详解 压缩文件包...
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Salinity_Based_灌溉水盐度对椰枣树根际细菌群落影响研究数据
数据集概述 本数据集聚焦灌溉水盐度对椰枣树根际细菌群落的影响,通过16S rRNA基因 metabarcoding技术分析非盐水与盐水灌溉条件下的细菌群落差异,包含OTU分布、多样性指数及环境因子相关性数据,共85个文件。 文件详解 测序数据文件...
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Y_chromosome_Based_棕熊与北极熊Y染色体基因流研究数据
数据集概述 本数据集为棕熊与北极熊Y染色体基因流研究相关数据,基于13个新型Y染色体序列及微卫星标记,对130只棕熊和北极熊样本开展分析,还涉及390kb Y染色体支架的测序数据研究,用于揭示两者系统发育关系及雄性偏向基因流情况。 文件详解 文件名称:Submission DRYAD allele sizes.xlsx 文件格式:XLSX...
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Ago2_Based_小鼠海马神经干细胞与分化神经元单细胞转录本测序数据
数据集概述 本数据集包含新生小鼠海马神经干细胞(NSC)及体外分化神经元的Ago2转录本Sanger测序数据,通过SNP鉴定转录本的母源或父源等位基因来源,与研究图5相关。共包含9个文件,均为压缩格式。 文件详解 神经干细胞测序数据文件 文件名称:12-11-20 Ago2 NSCs.zip、30-04-21 Ago2 2nd...
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MBMG_补充材料_6_淡水底栖动物DNA元条形码测序数据统计_2018
数据集概述 本数据集是论文《A DNA metabarcoding protocol for hyporheic freshwater meiofauna: Evaluating highly degenerate COI primers and replication...
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贾拉哈金_Jararhagin_在小鼠腓肠肌中的非编码RNA表达数据揭示
数据集概述 本数据集记录蛇毒金属蛋白酶(jararhagin)暴露后小鼠腓肠肌的非编码RNA组全局表达谱,包含实验组(右爪注射jararhagin,n=4)与对照组(左爪注射PBS,n=4)的小RNA(smRNAs)及微小RNA(microRNAs)表达数据,基于暴露24小时后的smRNA-Seq文库构建,共1个文件。 文件详解...
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来自Lefort等人的补充材料2_蚜虫食物网高通量DNA测序补充材料数据
数据集概述 本数据集为Lefort等2017年发表的蚜虫食物网高吞吐量DNA测序研究的补充材料2,包含一份Excel文件,用于支持蚜虫食物网中更高营养级相互作用的研究,为生态食物网分析提供数据支撑。 文件详解 文件名称:oo_155606.xlsx 文件格式:XLSX...
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Doedicurus_Based_南美巨型雕齿兽古DNA进化关系研究数据
数据集概述 本数据集包含已灭绝南美巨型雕齿兽(Doedicurus sp.)的古DNA研究相关数据,涉及雕齿兽及现存犰狳的测序数据、系统发育分析文件、NGS流程脚本等,用于揭示雕齿兽的进化起源与系统发育关系,支持古生物进化研究。 文件详解 测序数据文件...
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Dryad_Based_外显子捕获系统发育基因组学蜥蜴演化研究数据2015
数据集概述 本数据集为外显子捕获系统发育基因组学研究相关数据,针对澳大利亚石龙子蜥蜴(冠群年龄约8000万年)开展,使用目标富集技术测序约3000个蛋白编码外显子,研究不同系统发育分化水平下目标基因座的富集效率,同时开发了低至中等分化样本的分析工作流程。 文件详解 README_for_dryad_34274.zip.txt 文件格式:TXT...
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Dryad_Based_人类干扰对溪流真菌群落功能与结构变异性影响研究数据
数据集概述 本数据集围绕人类干扰(农业用地)和自然压力(特定地质导致的低pH)对溪流真菌分解者群落及叶片分解速率时间变异性的影响展开研究。通过下一代测序技术(焦磷酸测序)分析真菌群落组成,对比不同干扰类型溪流的功能与结构变异性差异,为生态系统功能稳定性研究提供数据支持。 文件详解 文件名称:Dryad.zip 文件格式:ZIP(压缩包)...



