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SARS_CoV_2与人类蛋白质相互作用图谱及药物靶点数据集
数据集概述 该数据集包含SARS-CoV-2与人类蛋白质的相互作用信息,涉及332个高置信度相互作用及67个可成药人类蛋白质靶点,由Krogan实验室通过亲和纯化质谱技术获取,为抗病毒药物研发提供支持。 文件详解 文档类文件(共4个): README.2020.04.30.pdf:PDF格式,数据集说明文档...
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子宫内膜癌肿瘤内异质性蛋白质组学表征数据集
数据集概述 本数据集基于SWATH技术的蛋白质组学分析,对子宫内膜癌患者不同肿瘤部位的组织样本进行蛋白质谱分析,揭示同一患者肿瘤内的蛋白质表达差异,识别了与临床特征相关的生物标志物,为研究肿瘤异质性机制及潜在药物靶点提供数据支持。 文件详解 补充图表文件:...
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NSD3驱动的肺鳞状细胞癌基因表达谱探索数据集
数据集概述 本数据集围绕NSD3在肺鳞状细胞癌中的作用展开,通过分析TCGA数据库中NSD3扩增与非扩增、高表达与低表达样本的基因表达谱,旨在识别NSD3调控的致癌信号通路,揭示其在基因表达中的生物学功能。 文件详解 差异表达分析数据文件(CSV格式):...
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相对自由能计算基准数据集2018
数据集概述 本数据集为相对自由能计算提供基准,包含CDK8、c-Met、Eg5、Hif2a、PFKFB3、SHP2、SYK、TNKS2等靶点相关的基准数据,由Merck KGaA研究人员创建,用于相关计算方法的验证与评估。 文件详解 文件名称:fep-benchmark-v3.zip 文件格式:ZIP压缩包...
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SARS_CoV_2刺突蛋白中和抗体表位数据集
数据集概述 该数据集包含经实验验证的、位于SARS-CoV-2刺突蛋白上的中和抗体靶向表位信息,数据来源于IEDB数据库,以PDF文档形式呈现。 文件详解 文件名称: Neutralizing antibodies epitopes sequences.pdf 文件格式: PDF 内容说明: 包含SARS-...
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雷帕霉素耐药DLBCL细胞系微阵列数据重新分析数据集
数据集概述 本数据集是对DLBCL细胞系雷帕霉素耐药性相关微阵列原始数据的重新分析结果,识别出200余个显著差异表达基因,重点关注CD247和SYK等与耐药性相关的关键基因,为DLBCL耐药机制研究提供数据支持。 文件详解 差异表达基因文件:...
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USP5锌指泛素结合域与化合物XSR00035795a共晶结构及选择性测试数据集
数据集概述 该数据集包含USP5锌指泛素结合域(Zf-UBD)与化合物XSR00035795a的共晶结构数据,以及通过表面等离子体共振实验测试化合物选择性的相关文件,用于分析配体与结合口袋的相互作用及甲基基团对USP5/HDAC6选择性的影响。 文件详解 XSR00035795a.mtz: MTZ格式文件,可能为晶体学数据文件,存储衍射数据相关信息...
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药物发现中激酶组选择性自由能计算Wee1案例研究数据集
数据集概述 该数据集包含论文《Harnessing free energy calculations for kinome-wide selectivity in drug discovery campaigns with a Wee1 case...
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尿素转运蛋白B_UT_B_SLC14A1_靶点赋能包
数据集概述 本数据集围绕尿素转运蛋白B(UT-B;SLC14A1)展开,包含其结构解析(apo状态晶体结构、抑制剂结合态冷冻电镜结构)及抑制剂结合的体外验证数据,为该靶点的分子表征及新型利尿剂等疗法开发提供支持。 文件详解 文件名称: SLC14A1 TEP_v1.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容: 靶点赋能包文档,涵盖UT-...
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TMEFF2靶标赋能包数据集
数据集概述 本数据集围绕TMEFF2蛋白展开,该蛋白是一种研究不足但可能与阿尔茨海默病(AD)病理调节相关的蛋白质。数据集包含针对TMEFF2的靶标赋能包(TEP)资料,旨在为其在AD发病机制中的潜在作用研究提供支持。 文件详解 文件名称: TREAT-AD Basic TEP_TMEFF_v1.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
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DrugProt语料库_BioCreative_VII_Track1_药物化学物质_蛋白质相互作用文本挖掘数据集
数据集概述 该数据集是BioCreative VII Track 1任务的金标准标注语料库,包含训练集、开发集、测试集及背景集,涵盖PubMed摘要、人工标注的化学物质/基因实体及化学-蛋白质关系,用于推动药物发现、精准医疗相关的文本挖掘系统开发。 文件详解 训练集文件夹...
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药物_靶点相互作用预测框架数据集
数据集概述 该数据集包含基于知识图谱和推荐系统的药物-靶点相互作用(DTI)预测框架相关代码与数据,涵盖多种预测方法的实现脚本、多来源DTI数据集及知识图谱数据,为DTI预测研究提供完整的实验支持。 文件详解 该数据集以压缩包形式提供,包含代码脚本和数据目录,具体说明如下: - 代码脚本: - kge_nfm.py: 实现KGE_NFM与NFM预测方法...
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亨廷顿蛋白互作伴侣镍和FLAG下拉实验结果数据集
数据集概述 本数据集记录了针对亨廷顿蛋白(HTT)互作伴侣的镍和FLAG下拉实验结果,聚焦于HD致病关键的Exon 1区域,旨在通过筛选互作蛋白稳定该区域结构以获取更高分辨率图像,为亨廷顿病研究提供实验数据支持。 文件详解 该数据集包含两个PDF格式的文档文件,具体说明如下: - 文件名称: Supplementry Info.pdf - 文件格式:...
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ScienceSignaling_CARTK_Based_2024CARTK结构模型分析完整数据
数据集概述 本数据集包含两个iCn3D PNG格式的嵌合抗原受体酪氨酸激酶(CARTK)结构模型文件,对应2024年《Science Signaling》论文的研究内容,支持通过iCn3D工具进行可视化与分析。 文件详解 CARTK1in_CARTK2in_CARTK3in_CARTK4in_colored-secondary-...
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RhoA突变体构象研究原始质谱数据
数据集概述 本数据集包含RhoA突变体构象研究的原始质谱数据,用于支持通过紫外光解离与X射线衍射技术整合发现RhoA突变体非明显可靶向构象的研究。 文件详解 文件名称: MS Raw Data.zip 文件格式: ZIP (.zip) 文件内容: 压缩包内为RhoA突变体构象研究相关的原始质谱数据文件,具体数据内容需解压后查看 适用场景...
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IFITM3依赖的内体抗病毒免疫相关原始实验数据
数据集概述 本数据集包含Unali等人发表于EMBO J的开放获取研究论文中的原始实验数据,围绕干扰素诱导磷脂调控IFITM3依赖的内体抗病毒免疫主题,涵盖多种细胞系与病毒实验的定量数据,支持相关免疫机制研究。 文件详解 数据文件(共74个): 71个.csv格式文件:记录不同实验的原始定量数据,如Fig. EV5E_hACE2 quant in...
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药物活性预测多模型融合数据集
药物活性预测多模型融合数据集_Drug_Activity_Prediction_Multi_Model_Fusion_Dataset 数据来源:互联网公开数据 标签:药物研发, 机器学习, 生物活性, 多标签分类, 模型融合, 预测分析, 药物靶点, 数据挖掘 数据概述:...
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药物靶点预测化合物活性数据集
药物靶点预测化合物活性数据集_Drug_Target_Prediction_Compound_Activity_Dataset 数据来源:互联网公开数据 标签:药物发现, 靶点预测, 化合物活性, 生物信息学, 机器学习, 多标签分类, 深度学习, 高通量筛选 数据概述:...
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药物活性预测多模型融合结果数据集
药物活性预测多模型融合结果数据集_Drug_Activity_Prediction_Multi_Model_Fusion_Results 数据来源:互联网公开数据 标签:药物研发, 生物活性, 机器学习, 模型融合, 预测, 药理学, 药物靶点, 深度学习 数据概述:...
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药物靶点相互作用预测数据集
药物靶点相互作用预测数据集_Drug_Target_Interaction_Prediction_Dataset 数据来源:互联网公开数据 标签:药物研发, 靶点预测, 机器学习, 生物化学, 分子结构, 药物分子, 蛋白质序列, 数据挖掘 数据概述:...



