数据集 - 海数据

Development_validation_high_throughput_非模式物种序列标记设计与分析数据

2025年12月28日

数据集概述本数据集围绕非模式物种序列标记的开发、验证及高通量分析展开，提供了适用于无参考基因组物种的遗传标记设计框架相关数据，包含标记序列、基因型数据、生物信息学脚本及参考序列等，可支持群体遗传学、系统发育学研究中标记的应用与分析。文件详解 VCF_files.tar 文件格式：TAR（压缩包）...

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番薯属两种牵牛花基因流与分化选择数据集

2025年12月19日

数据集概述本数据集围绕番薯属两种姐妹牵牛花（Ipomoea cordatotriloba和I. lacunosa）的基因流、分化选择及渐渗抗性展开研究，通过基因组SNP数据揭示物种形成早期选择与基因流的复杂相互作用，为岛屿分化源于分化选择的理论提供实证支持。文件详解...

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北美西部本土丛生禾草_沙生针茅_精细尺度空间遗传结构数据集

2025年12月22日

数据集概述本数据集聚焦北美西部本土丛生禾草沙生针茅（Achnatherum thurberianum），通过简化基因组测序获取17个种群246个个体的5677个SNP位点数据，分析其种群遗传结构、进化历史及环境适应性，为恢复规划提供参考。文件详解...

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WES_基准测试_nf_core_sarek_v3_1_1_WES变异检测完整数据

2025年12月22日

数据集概述该数据集包含使用nf-core/sarek v3.1.1流程在基准测试数据集上生成的全外显子组测序（WES）变异检测结果，涵盖不同样本、覆盖度和变异检测工具的输出文件及报告。文件详解变异检测结果文件（.gz格式）：...

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黑腹果蝇基因组结构变异检测与基因分型数据集

2025年12月22日

数据集概述该数据集包含使用Genomestrip/2.0工具，对黑腹果蝇（D.melanogaster）Sussex LHM半克隆系及一个内部参考系个体的基因组结构变异进行检测与基因分型的代码、日志、数据及摘要。数据涵盖原始与过滤后的CNV结果、提交至NCBI dbVAR的变异文件等，为相关基因组研究提供支持。文件详解代码文件:...

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普通王蛇物种复合体谱系结构数据集

2025年12月19日

数据集概述本数据集围绕普通王蛇物种复合体（Lampropeltis getula）的谱系结构展开，包含基因组序列数据、环境变量数据及分析结果文件，用于研究北美地区气候、地理与历史对其遗传分化及谱系形成的影响。文件详解遗传数据文件：...

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DGRP黑腹果蝇基因型向参考基因组v6_0转换及质控图表数据集

2025年12月18日

数据集概述本数据集包含DGRP黑腹果蝇基因型从旧版本向参考基因组v6.0转换的结果，涵盖VCF和PLINK格式基因型文件、转换运行代码、日志文件、统计摘要及质控图表，用于展示SNP位置变化情况。文件详解基因型数据文件： dgrp2_dm6_dbSNP.vcf.gz：压缩VCF格式基因型文件...

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硬粒小麦_Kronos_染色体水平基因组组装数据集

2025年12月13日

数据集概述本数据集包含硬粒小麦'Kronos'的染色体水平基因组组装及相关突变分析数据，含外显子捕获和启动子捕获测序的突变识别结果，采用MAPS流程分析并通过SnpEff预测变异效应，数据使用遵循多伦多协议的预发布共享原则。文件详解文件名称及格式： Kronos_v1.1_Exome-...

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北美东部及西弗吉尼亚州入侵植物忍冬种群结构研究数据集

2025年12月13日

数据集概述本数据集围绕入侵植物忍冬（Lonicera japonica）的种群结构展开，包含用于基因分析的SNP数据文件及相关研究图表，为探究北美东部及西弗吉尼亚州该入侵物种的种群特征提供数据支持。文件详解文件名称: Jh2_tassel_LD_thinned.vcf.recode.vcf 文件格式: VCF (.vcf) 内容说明:...

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斑马鱼实验室驯化遗传特征数据集

2025年12月12日

数据集概述该数据集通过RAD-seq技术对印度、尼泊尔、孟加拉国的野生斑马鱼种群及四种常见实验室品系进行遗传特征分析，对比野生种群与实验室品系的遗传多样性、杂合度等指标，揭示实验室驯化对斑马鱼遗传背景的影响。文件详解 wildlabdanio.vcf.gz：VCF压缩格式文件，包含野生斑马鱼种群及实验室品系的遗传变异数据...

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TAILVAR终止密码子分析与延长变体预测数据集

2025年12月12日

数据集概述该数据集包含TAILVAR评分开发的相关文件，TAILVAR评分用于评估终止密码子（TAA、TGA、TAG）处终止缺失变体的功能影响。TAILVAR基于随机森林模型预测终止缺失变体的致病性，整合多种预测评分、转录本特征和蛋白质上下文信息，输出0-1的致病性概率评分。文件详解...

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历史转座子动员波与作物病原菌适应性变异关联研究补充文件集2025

2025年12月11日

数据集概述本数据集为“历史转座子动员波在主要作物病原菌中创造独特适应性变异库”研究的补充文件集，包含转座子多态性检测基准测试、泛基因组组装注释、适应性变异定位等核心研究材料，支持解析病原菌适应性进化机制。文件详解 README.txt:...

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Graph2VR_用例2_Based_生物医学数据可视化转换完整数据集

2025年12月10日

数据集概述该数据集包含Graph2VR用例2的数据创建过程相关文件，涵盖原始数据提取、格式转换、脚本工具等内容，支持VIP工具的数据集生成与处理，适用于生物医学领域的数据分析与处理场景。文件详解文档与许可文件： README.md：Markdown格式，说明Graph2VR用例2数据集创建步骤、依赖工具及处理日志...

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果蝇对新型实验室环境适应性的选择等位基因轨迹数据集

2025年12月9日

数据集概述该数据集记录了黑腹果蝇在新型实验室环境下的适应性进化过程，通过实验进化与Pool-Seq全基因组测序技术，识别了5000余个偏离中性预期的选择等位基因（SNP），并追踪其异质性进化轨迹（持续上升或先升后稳），为进化生物学中环境适应的基因组机制研究提供数据支持。文件详解文档类文件： Description of Bioinformatic...