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分化CAD5细胞表面PrPC二次文库验证数据集
数据集概述 该数据集包含分化CAD5细胞中定制二次验证CRISPR/Cas9敲除文库的NGS原始测序数据,通过流式分选标记为PrPC低表达或高表达群体,支持相关基因功能的生物信息学分析。 文件详解 数据集包含10个压缩格式的原始测序文件,存储于单一目录中: 目录名称:Secondary Library Validation Surface PrPC -...
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肠炎沙门氏菌WbaP结构关联数据集
数据集概述 本数据集包含肠炎沙门氏菌WbaP蛋白的结构关联数据,涵盖XLMS交联数据、CDMS数据、AlphaFold生成的二聚体模型及Foldseek分析结果,为该蛋白结构研究提供多维度数据支持。 文件详解 主目录文件: S_enterica_WbaP_foldseek_afdb-...
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BindDB假基因案例研究数据集
数据集概述 本数据集是基于BindDB平台的假基因案例研究资料,通过查询76个带"ps"后缀的假基因启动子区域,分析其表观遗传特征与转录活性,发现多数假基因呈无活性染色质状态,少数存在活性标记及转录因子结合。 文件详解 数据集包含一个PDF格式的文档文件,具体如下: - 文件名称: BindDB Pseudogenes Case...
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BMAL1_TAD_15N_1H_ZZ交换弛豫实验完整数据60C
数据集概述 本数据集包含BMAL1转录激活结构域(TAD)在60°C条件下进行的15N-1H ZZ交换实验数据。数据由24个不同时间延迟的核磁共振谱图文件(.ft格式)和1个时间参数文件(times.txt)组成,记录了从0秒到3秒共24个时间点的交换动力学过程。化学位移归属信息可在BMRB(生物磁共振数据库)中查询。 文件详解...
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CRISPR_Cas9基因编辑HEK293细胞无抗生素培养基生物加工数据集
数据集概述 本数据集为通过CRISPR/Cas9基因编辑技术使HEK293细胞适用于无抗生素培养基生物加工的研究提供支持,包含CRISPR预测位点的测序数据,以.ab1格式存储相关实验结果。 文件详解 目录: Data for Enabling HEK293 cells for antibiotic-free media bioprocessing...
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RMF刺激后巨噬细胞代谢物定量分析数据集
数据集概述 该数据集包含RAW 264.7细胞极化的M2巨噬细胞在MNM处理及1Hz旋转磁场(RMF)刺激15分钟后的代谢物定量分析原始数据,通过液相色谱-质谱法检测,为研究RMF对巨噬细胞代谢的影响提供支持。 文件详解 文件名称:Raw data of metabolic quantitative analysis.rar...
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组蛋白伴侣FACT协调H2A_X依赖的DNA损伤信号传导与修复数据集2018
数据集概述 本数据集为2018年Mol Cell发表的研究论文配套原始数据,包含显微镜图像、蛋白质印迹扫描、流式细胞术数据及图像分析结果,围绕组蛋白伴侣FACT在H2A.X依赖的DNA损伤信号传导与修复中的作用展开,涉及紫外线损伤修复过程中组蛋白变体模式的重塑研究。 文件详解 该数据集包含压缩格式的原始数据文件,按主图和补充图分类存储,具体说明如下:...
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原发性与复发性胶质瘤DNA甲基化及HOMER数据集
数据集概述 本数据集包含原发性与复发性胶质瘤病例的DNA甲基化原始IDAT文件及HOMER基序分析数据,是Souza等人2018年4月发表于《Cell Reports》研究的相关数据,为胶质瘤表观遗传学与分子机制研究提供支持。 文件详解 根目录文件: Metadata_Mendeley.xlsx:Excel格式文件,可能包含样本元数据信息...
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CAD_META冠心病遗传关联荟萃分析完整数据
数据集概述 本数据集是冠心病遗传关联研究的荟萃分析结果,包含从全基因组关联研究中汇总的遗传变异统计数据。数据来源于已发表的科学研究,提供了单核苷酸多态性位点与冠心病风险关联的效应大小、频率、标准误和显著性等关键统计指标,以及异质性检验结果。 文件详解 CAD_META.readme.txt 文件格式: TXT 字段映射介绍:...
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SMARCA3蛋白与H3K9me3调控研究免疫荧光原始图像数据集
数据集概述 本数据集包含Akano和Hebert等人发表的关于SMARCA3蛋白调控H3K9me3的研究中,未处理、未压缩的免疫荧光原始图像。图像分三个通道,分别代表DAPI、H3K9me3和FLAG信号,共一百八十一幅,存储于七个目录中。 文件详解 目录结构:数据集包含七个二级目录,按重复实验(Rep 1/2/3)和目标蛋白(FLAG-...
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拓扑异构酶III_B与DEAD_box解旋酶DDX5协同解析R环数据集
数据集概述 本数据集为学术论文《Resolution of R-Loops by topoisomerase III-B (TOP3B) in coordination with the DEAD-box helicase DDX5》的原始数据,包含实验相关的图像文件,围绕拓扑异构酶III-B与DDX5协同解析R环的机制研究展开。 文件详解...
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中华蜜蜂胰岛素样肽2基因_AccILP_2_分子克隆及不同胁迫条件下的表征数据集
数据集概述 该数据集围绕中华蜜蜂(Apis cerana cerana)胰岛素样肽2基因(AccILP-2)展开,包含其分子克隆序列及不同胁迫条件下的定量PCR结果数据。数据集由12个文件构成,涵盖基因序列文档、SDS格式实验结果文件及TXT格式序列文件,为研究该基因结构及胁迫响应机制提供基础数据支持。 文件详解 基因序列文档:...
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RAW264_7细胞经LPS和DMPO处理的转录组变化Illumina芯片数据集
数据集概述 该数据集记录了RAW264.7巨噬细胞在四种条件(对照组、DMPO处理组、LPS处理组、DMPO+LPS处理组)下的转录组变化,包含超过45000个基因的芯片分析数据,通过三次重复实验获取,用于验证DMPO对LPS诱导细胞活化的抵抗作用。 文件详解 文件名称: Microarray data- Ramirez-Gomez Mejiba-...
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小分子靶向招募核糖核酸酶降解c9ALS_FTD_r_G4C2_重复扩增的RNA_seq数据集
数据集概述 该数据集包含针对小分子靶向招募核糖核酸酶降解c9ALS/FTD r(G4C2)重复扩增的RNA-seq实验数据,涵盖患者来源iPSC、健康供体iPSC、PWR500小鼠及患者来源iPSN四种样本类型,用于评估化合物对转录组的影响。 文件详解 文件名称:SET1 ALS iPSC Sequencing.xlsx...
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泛癌AID体细胞相关突变图谱与ICI反应潜在作用数据集
数据集概述 本数据集为泛癌研究相关的补充材料,包含AID体细胞相关突变图谱及其与免疫检查点抑制剂(ICI)反应潜在关联的图表数据。数据集由补充图表和补充表格两类文件构成,覆盖多种文件格式,为泛癌突变特征及免疫治疗反应的研究提供支撑。 文件详解 该数据集由补充图表和补充表格两类文件组成,具体说明如下: - 补充图表文件(位于 Supplementary...
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mTORC1磷酸化乙酰转移酶p300调控自噬与脂质生成数据集
数据集概述 本数据集是论文《mTORC1 Phosphorylates Acetyltransferase p300 to Regulate Autophagy and Lipogenesis》的原始数据,包含与mTORC1、p300基因相关的生物学实验原始材料,为研究基因调控自噬和脂质生成提供数据支持。 文件详解 目录:mTORC1...
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利什曼原虫N2N2_二甲基鸟苷tRNA甲基转移酶数据集
数据集概述 本数据集聚焦于利什曼原虫(HU3株)的N2N2-二甲基鸟苷tRNA甲基转移酶相关信息,包含该蛋白质的名称、对应生物分类及关联的Wikidata标识等基础数据内容。 文件详解 文件名称: LDHU3_13.1040/LDHU3_13.1040.txt 文件格式: TXT(.txt) 内容字段: Wikidata:...
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婴儿利什曼原虫RNA结合蛋白RBP12数据集
数据集概述 该数据集包含婴儿利什曼原虫(JPCM5株)RNA结合蛋白RBP12的相关信息,以文本文件形式存储,为研究该蛋白的结构与功能提供基础数据支持。 文件详解 文件名称: LINF_180010900/LINF_180010900.v2.txt 文件格式: TXT(.txt) 字段映射: Wikidata:...
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利什曼原虫HU3株U5小核核糖核蛋白200_kDa解旋酶数据集
数据集概述 本数据集包含利什曼原虫HU3株(Leishmania donovani HU3 strain)中U5小核核糖核蛋白200 kDa解旋酶(U5-200K/Brr2)的相关信息,以文本文件形式存储基础蛋白数据。 文件详解 文件名称: LDHU3_17.1450/LDHU3_17.1450.txt 文件格式: TXT(.txt) 字段映射:...
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膳食宏量营养素对小鼠肝脏脂肪酸谱影响数据集
数据集概述 本数据集包含暴露于四种不同膳食的雄性C57BL/6小鼠的肝脏脂肪酸谱个体数据,膳食变量为两种脂肪水平(40%和55%能量)与酪蛋白或乳清蛋白分离物(30%能量)的组合,用于分析膳食宏量营养素对肝脏代谢组的影响。 文件详解 文件名称: Nychyk et al 2020 CR Figure S3.xlsx 文件格式: Excel...



