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六个豆科植物基因组中碱性亮氨酸拉链转录因子基因家族全基因组分析数据集
数据集概述 该数据集围绕六个豆科植物(大豆、蒺藜苜蓿、菜豆、鹰嘴豆、木豆、百脉根)的碱性亮氨酸拉链(bZIP)转录因子基因家族展开全基因组分析,包含基因鉴定、系统发育分类、结构特征、表达模式及胁迫响应等核心数据,为研究豆科bZIP家族的分子功能与进化提供支持。 文件详解 文件名称: Phylogenetic tree of all bZIP...
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马来西亚半岛蜂类拟态透翅蛾新物种DNA条形码多序列比对补充材料
数据集概述 本数据集为马来西亚半岛蜂类拟态透翅蛾新物种研究的补充材料,核心内容是相关物种DNA条形码序列的多序列比对数据,包含Pyrophleps属、Heterosphecia属及Aschistophleps属共七种/三个标本的序列比对信息。 文件详解 文件名称: oo_151477.pdf 文件格式: PDF 内容说明: 包含Pyrophleps...
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霞多丽基因组组装与注释数据集
数据集概述 本数据集包含霞多丽(Chardonnay)葡萄的基因组组装数据及相关注释信息,涵盖组装序列、基因预测、功能注释、重复序列、染色体定位、亲本溯源等多维度内容,为葡萄基因组学研究提供全面的数据支持。 文件详解 基因组组装文件: chardonnay_p-ctg.fasta.gz:FASTA格式,单倍体主组装序列(primary contigs)...
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Alpha_synuclein_ColabFold_Based_α_突触核蛋白结构建模完整数据
数据集概述 本数据集包含通过ColabFold工具对野生型人类α-突触核蛋白(alpha-synuclein)及其Ser129Asp突变体进行结构建模的结果,涵盖蛋白质结构模型文件、建模日志、参考文献、预测精度评估图表等多种类型文件,为研究该蛋白质野生型与突变体的结构差异提供数据支持。 文件详解 该数据集包含多种类型的文件,具体说明如下: -...
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环节动物再生与无性繁殖系统发育分布数据集2016
数据集概述 该数据集是2016年《Invertebrate Biology》的补充数据,聚焦环节动物的再生与无性繁殖(分裂)特征的系统发育分布,包含数据库表、文献参考、序列比对及系统发育树等多类型文件,为相关进化研究提供数据支持。 文件详解 数据文件:...
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中欧黄唇蛇蛉种群来源研究补充材料
数据集概述 该数据集为学术研究补充材料,包含基于细胞色素c氧化酶亚基3(cox3)序列的多序列比对数据,用于探究中欧黄唇蛇蛉种群的来源问题,支持相关分子系统学分析。 文件详解 文件名称: oo_583161.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容: 包含基于细胞色素c氧化酶亚基3(cox3)序列的多序列比对数据,为学术研究的补充文档。...
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多序列比对自动化过滤方法对单基因系统发育推断影响数据集
数据集概述 该数据集围绕多序列比对(MSA)自动化过滤方法对单基因系统发育推断的影响展开,包含实证与模拟数据,用于对比过滤与未过滤比对在系统发育树重建中的表现,为相关方法评估提供支持。 文件详解 文件名称: rawData.zip,文件格式: ZIP,包含原始数据的压缩包,具体内容需解压后查看 文件名称:...
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GPCR功能特化进化引导残基分析数据集
数据集概述 本数据集包含用于研究GPCR功能特化的自动化直系同源识别流程生成的原始及中间文件,覆盖837个人类GPCR及3个额外受体,含BLAST+输出、多序列比对、系统发育树等关键分析文件。 文件详解 文件名称: GPCR_Ortholog_Identification_Files.zip 文件格式: ZIP压缩包 包含内容:...
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啤酒花着丝粒重复序列与反转录转座子动态模式数据集
数据集概述 本数据集聚焦啤酒花(Humulus lupulus L.)着丝粒区域的重复序列与反转录转座子动态模式,包含CENH3抗体设计原始数据、着丝粒重复序列共识序列及重复组分析结果,为研究啤酒花着丝粒结构提供基础数据。 文件详解 文件名称: index.html,文件格式: HTML,内容:...
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疱疹病毒蛋白长期与短期演化的功能和结构决定因素数据集
数据集概述 本数据集包含疱疹病毒(HSV1、HCMV、KHSV)编码基因相关的系统发育树、多序列比对、PDB结构及质谱文件,支持研究其蛋白演化的功能与结构决定因素。 文件详解 该数据集包含5个ZIP格式压缩文件,具体说明如下: - 文件名称: INTERSPECIES_TREES.zip - 文件格式: ZIP - 内容:...
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海洋线虫DNA宏条形码参考数据集评估补充材料29
数据集概述 本数据集为海洋线虫DNA宏条形码研究的补充材料,包含基于不同多序列比对的最大似然分析结果,评估线虫科分类单元的分辨率及单系分支的 bootstrap 支持度,记录多系或并系状态。 文件详解 文件名称: oo_96345.pdf 文件格式: PDF (.pdf) 文件内容:...
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假新芽孢杆菌JJ_79在芽孢杆菌科内的系统发育定位数据集
数据集概述 该数据集包含系统发育树及相关序列数据,用于评估假新芽孢杆菌JJ-79在芽孢杆菌科512个模式菌株中的系统发育定位。基于三个多基因数据集(BM1、BM2、BM3)构建系统发育树,提供序列比对、树结构及可视化文件。 文件详解 BM1相关文件: BM1.faa:FASTA格式,87个保守基因的过滤后多序列比对拼接文件...
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中欧Ornatoraphidia_flavilabris种群来源研究补充材料2
数据集概述 本数据集为关于中欧Ornatoraphidia flavilabris种群来源研究的补充材料,核心内容是基于细胞色素c氧化酶亚基1(cox1)序列的多序列比对数据,以PDF格式呈现,为该物种种群起源研究提供分子生物学数据支持。 文件详解 文件名称:oo_583160.pdf 文件格式:PDF(.pdf)...



