GPCR功能特化进化引导残基分析数据集

数据集概述

本数据集包含用于研究GPCR功能特化的自动化直系同源识别流程生成的原始及中间文件,覆盖837个人类GPCR及3个额外受体,含BLAST+输出、多序列比对、系统发育树等关键分析文件。

文件详解

  • 文件名称: GPCR_Ortholog_Identification_Files.zip
  • 文件格式: ZIP压缩包
  • 包含内容:
  • BLAST+搜索输出(表格格式):基于UniProtKB 2021年7月14日版本,记录每个受体前三个人类旁系同源物的匹配结果
  • 多序列比对文件:使用MAFFT的fftnsi和linsi算法生成,经ClipKit修剪
  • 系统发育树文件:Newick格式,包含FastTree2(初筛)及IQ-TREE 2/RAxML-NG(复筛)生成的最大似然树,用于筛选直系同源序列

适用场景

  • GPCR功能进化研究:分析直系同源序列的进化关系与功能特化机制
  • 生物信息学方法验证:评估自动化直系同源识别流程的准确性与效率
  • 蛋白质结构功能分析:结合序列比对与系统发育数据,解析关键残基的功能保守性
  • 计算基因组学研究:探索GPCR家族分化的分子机制与进化驱动力
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 687.5 MiB
最后更新 2025年12月5日
创建于 2025年12月5日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。