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Peromyscus_leucopus_Based_白足鼠城市与农村种群转录组资源数据
数据集概述 本数据集为白足鼠（Peromyscus leucopus）的转录组资源，包含通过454和SOLiD 5500XL平台测序组装的参考转录组、注释信息、SNP、SSR标记及基因表达差异分析结果，用于研究城市与农村种群的生态遗传分化及对城市化的进化响应，共9个文件。 文件详解 转录组序列文件...
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Siegel_Lab_Based_布氏锥虫Tb427菌株基因组组装流程数据0_0_3版
数据集概述 本数据集为布氏锥虫Lister 427菌株（Tb427）的基因组组装数据，包含0.0.3版本发布的v12和v11两个版本的基因组组装文件。v12版本提供了不同类型的组装形式（coreA、coreB、二倍体、二倍体 scaffolded），v11版本包含二倍体 scaffolded组装，所有组装文件均附带序列和注释信息。 文件详解...
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Island_Bat_Diets_Based_菲律宾岛屿蝙蝠物种饮食与栖息地关系研究数据
数据集概述 本数据集针对菲律宾宿务、保和、锡基霍尔岛的3种菊头蝠（Rhinolophus）和1种蹄蝠（Hipposideros）开展物种层面饮食分析，从77只蝙蝠粪便中识别出655个猎物分子操作分类单元（MOTUs），探究体型、回声定位频率及栖息地对蝙蝠食性分化的影响，包含16个相关文件。 文件详解 说明文档（README文件）...
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Spatio_temporal_Based_深海沉积物群落DNA和RNA宏条形码监测数据
数据集概述 本数据集为西北地中海海底峡谷及邻近斜坡区域的深海沉积物群落时空多样性监测数据，采用18S rRNA基因v7区域的真核生物标记进行宏条形码分析，包含5569个分子操作分类单元（MOTUs），主要类群为后生动物、囊泡虫和有孔虫，涉及季节和深度梯度的群落组成差异，以及DNA与RNA数据集的对比分析。 文件详解...
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Bombus_terrestris_Based_熊蜂微生物移植免疫响应与肠道菌群结构数据
数据集概述 本数据集围绕熊蜂（Bombus terrestris）微生物移植后的免疫响应与肠道菌群结构展开，通过将“抗性”和“易感”菌群移植到不同抗性背景的宿主中，研究宿主免疫系统活性与菌群抗性表型的关联，以及菌群组成差异，揭示宿主与菌群间的复杂反馈关系。 文件详解 PaperData.xlsx 文件格式：XLSX...
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Amphiporus_lactifloreus_带状蠕虫潜在新型毒素蛋白转录组分析数据集
数据集概述 本数据集为捕食性带状蠕虫Amphiporus lactifloreus的蛋白转录组分析结果，包含其潜在新型分泌毒素的相关数据。研究聚焦该蠕虫吻部表达的毒素样转录本及黏液蛋白质组中的分泌毒素成分，识别出金属蛋白酶、类海葵毒素等候选毒素，命名了两种新毒素U-nemertotoxin-1和U-nemertotoxin-2，共23个相关文件。...
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Corallorhiza_Lineage_Role_异养兰花复合群谱系与整合分类研究数据
数据集概述 本数据集为异养兰花Corallorhiza striata复合群的谱系与整合分类研究数据，包含基因组、形态、物候、繁殖模式、生态位及真菌宿主等多源数据，采用“谱系+生态角色”方法分析物种界定，涉及13个文件，覆盖序列比对、SNP数据、形态统计、开花时间等内容。 文件详解 基因组相关文件...
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Hadza_Prevotella_Based基因组组装与CAZy预测完整研究数据2023
数据集概述 本数据集包含Gellman et al. 2023年研究中Hadza Prevotella的基因组组装、注释及CAZy（碳水化合物活性酶）预测结果，涉及相关菌株（如Pcopri、Btheta、Buniformis）的基因组支架、基因注释文件、CAZy酶分类数据及分析代码，共47个文件，用于支持饮食来源碳水化合物对肠道菌群定植影响的研究。...
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Nesotrochidae_Based_新世界洞穴秧鸡新科命名线粒体基因组与系统发育数据
数据集概述 本数据集为Nesotrochidae新科命名相关研究的配套数据，包含两种鸟类（马达加斯加林秧鸡、福布斯林秧鸡）的线粒体基因组组装数据、11个线粒体基因的串联编码序列比对数据，以及基于BEAST2的系统发育分析输入输出文件，用于支持新世界洞穴秧鸡与新西兰adzebills亲缘关系的研究。 文件详解...
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Supplementary_Spirochaetales_四环素耐药突变分析与可复现脚本
数据集概述 本数据集包含螺旋体四环素耐药相关突变分析的补充材料，涉及16S rRNA、rpsC、rpsJ基因座的多序列比对文件、4张补充表格及分析脚本，用于确保研究可复现性，支持螺旋体目抗生素耐药性进一步研究，共9个文件。 文件详解 补充表格文件...
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PmNIES217_转录组_从头组装_Penium_margaritaceum及其元数据
数据集概述 本数据集包含Penium margaritaceum（PmNIES217）的转录组从头组装结果及相关注释元数据，由4个文件组成。数据涵盖转录组序列、蛋白组序列、功能注释表格等内容，支持对该藻类基因功能、蛋白结构及代谢通路的研究。 文件详解 TrinityTranscriptome.okay.fasta 文件格式：FASTA...
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Canarina_canariensis_Based_金丝桃遗传多样性与地理隔离研究数据
数据集概述 本数据集包含加那利岛特有植物金丝桃（Canarina canariensis）的遗传多样性研究数据，涉及叶绿体（cpDNA）单倍型和核基因组（AFLPs）的遗传变异分析，旨在探究火山群岛内古岛作为遗传多样性避难所和来源地的作用，揭示地理隔离与火山事件对种群遗传结构的影响。 文件详解...
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Atlantic_Spotted_Dolphin_Based种群结构与栖息地差异研究数据
数据集概述 本数据集围绕大西洋斑海豚的种群结构与栖息地差异展开研究，通过19个微卫星位点和线粒体控制区序列，分析西北大西洋、墨西哥湾及亚速尔群岛海域的种群遗传特征，识别出四个遗传聚类，揭示其受栖息地而非仅地理距离影响的复杂生物地理格局。 文件详解 压缩文件 文件名称：IM.zip、GSI.zip 文件格式：ZIP...
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Supporting_Data_Polydectinae蟹类海葵携带行为进化起源研究数据
数据集概述 本数据集为Polydectinae蟹类海葵携带行为进化起源研究的支撑数据，包含线粒体基因组序列、基因注释及相关序列比对文件。通过分析19种蟹类的线粒体基因组，结合系统发育重建与化石校准，探究该行为的起源时间与进化历程，结果显示其起源于始新世晚期，存在三个深度进化支系。 文件详解 README.md 文件格式：MD...
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eDNA_Metabarcoding_Based比利时小河流鱼类群落监测实验数据2018
数据集概述 本数据集为比利时小河流与大型溪流鱼类群落eDNA代谢组学监测实验数据，基于2018年6月的受控围笼实验，通过引入15种比利时本土鱼类，探究eDNA片段传输稀释规律及分子检测优化方法，分析eDNA相对丰度与笼内物种生物量的相关性，揭示不同流量下eDNA下游信号稳定性，共包含4份关联文件。 文件详解 README文件...
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Neodiprion_lecontei_Based松食叶蜂环境响应基因家族进化研究数据集
数据集概述 本数据集为松食叶蜂（Neodiprion lecontei）环境响应基因家族进化研究的配套数据，包含手动注释的基因序列、多物种比对文件及附录表格，覆盖嗅觉受体、味觉受体、细胞色素P450等5类基因家族，支持基因进化规律及适应性遗传变化的分析验证。 文件详解 说明文档 文件名称：README.md 文件格式：MD...
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Hippocampus_abdominalis_Based塔斯曼海海马遗传连通性研究数据
数据集概述 本数据集为海马（Hippocampus abdominalis）跨塔斯曼海遗传连通性研究的数据，包含42个文件，涉及线粒体DNA、微卫星等多基因座遗传数据及分析输入文件，用于研究该物种在澳大利亚东南部、塔斯马尼亚和新西兰沿海区域的历史迁徙、扩散模式及种群遗传结构。 文件详解 说明文件 文件名称：README.txt 文件格式：TXT...
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Ulmus_minor_Transcriptome_欧洲白榆转录组测序与分子标记开发数据
数据集概述 本数据集包含欧洲白榆（Ulmus minor）转录组大规模测序结果，涵盖转录组序列、功能注释及多态性分析数据。通过对不同抗荷兰榆树病（DED）水平的基因型进行测序，获得58,429个假定单基因（unigenes），并鉴定出30,693个多态性位点（含27,359个SNPs），为榆树分子研究提供工具。 文件详解 冗余序列信息文件：...
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descriptor_free_Based_细菌病原体抗原发现无描述符机器学习框架数据集
数据集概述 本数据集为论文“A descriptor-free machine learning framework to improve antigen discovery for bacterial...
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Chakarov_Apparent_鸟类Leucocytozoon媒介亲子传播研究数据集
数据集概述 本数据集为鸟类疟疾样寄生虫Leucocytozoon的媒介亲子传播研究相关数据，包含基因分型、微卫星序列、巢雏表、coxIII基因序列、基因型文件及分析代码等6个文件，支持验证宿主亲缘关系与寄生虫遗传相似性的关联，为媒介介导的准垂直传播机制研究提供数据基础。 文件详解 Genotypes used by Chakarov et al....
