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Microsatellite_脊椎动物转录组微卫星分析数据
数据集概述 本数据集包含三种脊椎动物(湖鲟、虎纹钝口螈、荒漠更格卢鼠)转录组的微卫星分析结果,涵盖转录组组装统计、微卫星分布及多态性评估等核心内容,是研究脊椎动物表达基因中微卫星分布的比较数据集,共含16个文件。 文件详解 文档类文件(.txt格式,7个) 名称:README_for_singleton msatcommander...
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DRYAD_Data_蚜虫寄生对营养与保护共生体影响研究数据
数据集概述 本数据集聚焦豌豆蚜(Acyrthosiphon pisum)寄生对其营养共生体(Buchnera)和保护共生体(Hamiltonella)的影响,包含寄生实验中的共生体丰度qPCR数据及相关基因序列,用于分析寄生蜂攻击下蚜虫共生体的动态变化及互作机制。 文件详解 文件名称:DRYAD.Copy...
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Sorghum_Based_高粱B染色体有无植株比较分析数据
数据集概述 本数据集为高粱(Sorghum purpureosericeum)B染色体有无植株的比较分析数据,包含B阳性与B阴性植株的测序数据、重复序列组装簇及比较分析结果,用于识别B染色体特异性重复序列簇及开发相关分子标记。 文件详解 文件名称:Spu_reads_B_positive.fasta 文件格式:FASTA...
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OGRDB_Based_CBA_J小鼠IGLV种系参考数据集
数据集概述 本数据集为发布于Open Germline Receptor Database(OGRDB)的CBA/J小鼠IGLV亚组免疫球蛋白受体种系参考集,包含4个相关文件,涵盖许可声明、JSON格式数据及两种FASTA格式序列文件,用于免疫受体相关研究的基础数据支撑。 文件详解 licence.txt 文件格式:TXT...
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Agabus_潜水甲虫物种复合体蛋白质表达与热耐受性研究数据
数据集概述 本数据集聚焦西地中海潜水甲虫物种复合体(Agabus ramblae和Agabus brunneus),研究其蛋白质表达与热耐受性、生态变化及物种分化的关联。包含蛋白质表达差异分析数据及参考EST文库相关文件,助力理解非模式物种进化与生态过程中的生理变化机制。 文件详解...
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Dataset_manuscript_生物基因数据集手稿数据
数据集概述 本数据集包含生物基因相关的手稿数据,涵盖基因序列比对、系统发育树及原始数据等内容。共8个文件,涉及FASTA、TRE、XLSX、GENEIOUS四种格式,主要用于生物信息学领域的基因数据处理与分析。 文件详解...
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CrERVγ_Based骡鹿内源性逆转录病毒种群历史研究数据
数据集概述 本数据集围绕骡鹿(Odocoileus hemionus)内源性逆转录病毒(CrERVγ)的种群历史展开,包含13个前病毒在15个种群262只骡鹿中的分布数据、骡鹿种群位置信息、白尾鹿CrERV-in14序列及微卫星数据,用于分析宿主-病毒共进化及宿主种群进化历史。 文件详解 Mule Deer_ERVData_Locations.xlsx...
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Lichens_Based全球分布地衣真菌群落多样性研究数据
数据集概述 本数据集围绕两种全球分布地衣(Rhizoplaca melanophthalma和Tephromela atra)的真菌群落(地衣...
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Memecylon_Based_植物演化与生物地理学研究数据集
数据集概述 本数据集围绕Memecylon属(野牡丹科)的演化与生物地理学研究展开,包含通过目标捕获技术获取的67个Memecylon类群的基因组数据,支持系统发育分析、分化时间估算、生物地理历史重建及形态特征演化研究,共7个相关文件。 文件详解 README.docx 文件格式:DOCX...
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Myotis_Source_欧洲同域蝙蝠营养生态位分化研究数据
数据集概述 本数据集聚焦欧洲同域分布的两种拖网蝙蝠(Myotis dasycneme与Myotis daubentonii),通过形态特征测量、食性分析等多方法整合研究其营养生态位分化。包含形态学、咬合力、负重能力及食性相关数据,揭示物种间细微生态位差异,为蝙蝠种间关系与资源利用研究提供支撑。 文件详解...
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Dryad_植物_AMF共生_外来入侵物种驱动本地植物进化数据
数据集概述 本数据集来自研究论文,聚焦外来入侵物种Alliaria petiolata对本地植物Pilea pumila菌根真菌(AMF)多样性的影响。通过分析不同共存历史的P. pumila种群,探究其共生AMF群落的进化变化,验证植物性状对菌根真菌多样性的决定性作用。数据集包含3个文件,覆盖研究数据、序列比对文件及说明文档。 文件详解 数据文件...
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芦笋转座子元件分析_河南师范大学植物基因组学数据库_2014年
数据集概述 本数据集为芦笋(Asparagus officinalis)基因组中转座子(TEs)的分析数据,基于男女芦笋基因组的Illumina HiSeq2000测序及生物信息学分析生成。数据包含17 Gb序列(12×覆盖度),组装为163,406个 scaffolds(总长400...
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Calicina_加州短程特有盲蛛辐射演化古生物地理学研究数据
数据集概述 本数据集围绕加州Calicina属25种短程特有盲蛛展开,包含21个物种的多基因校准物种树、形态数据及环境变量数据,用于重建该蛛形纲支系的时空生物地理历史,分析形态演化与环境变量的关系,揭示其从内华达山脉到海岸山脉的迁徙及趋同演化模式。 文件详解 基因序列文件(共3个)...
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CREMSA_Based_论文补充数据集_生物信息学_2025
数据集概述 本数据集为论文“CREMSA: Compressed indexing of (ultra) large alignments”的补充数据,包含三个用于验证研究可重复性的数据集:人工生成的随机数据集、HIV1基因组多序列比对数据集和主要促进子超家族蛋白质序列比对数据集。 文件详解...
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CHC_Mediated_基于表皮碳氢化合物的隐种分化研究数据
数据集概述 本数据集聚焦新热带区共生蚂蚁Crematogaster levior与Camponotus femoratus的隐种分化研究,包含两类蚂蚁的表皮碳氢化合物(CHC)数据、基因型序列、形态测量数据及环境关联分析材料,共18个文件,用于探究CHC在隐种分化中的作用及生态位分化特征。 文件详解 基因型序列文件(共11个.fasta文件)...
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BAGpipe_Source_植物DNA条形码分类鉴定流程数据
数据集概述 本数据集包含用于大规模生物多样性评估的自动化DNA条形码植物鉴定流程相关数据,涉及数据库构建、序列聚类、系统发育重建等步骤,以psbA-trnH标记为研究对象,结合系统发育与表型方法优化分类鉴定流程,并通过尼加拉瓜季节性干旱森林样本验证了方法的高效性与可靠性。 文件详解 README_for_BAGpipeAlignments.txt...
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Rye_Reference_NLRome_黑麦抗性基因注释数据
数据集概述 本数据集包含对近期发布的黑麦(Rye)参考基因组'Lo7'和'Weining'中核苷酸结合富亮氨酸重复序列(NB-LRR或NLR,主要抗性基因家族)的注释信息。旨在为黑麦NLRome的进一步研究及新型抗病品种选育提供有价值且易于获取的资源,共包含3个文件。 文件详解 文件名称:Lo7_NLRome_NB-ARC.fasta...
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Avian_influenza_virus_生物学基因序列数据
数据集概述 本数据集包含禽流感病毒(AIV)相关的基因序列数据,以FASTA格式压缩存储,核心文件为aiv-rate-heterogeneity-v1.1.zip。数据聚焦生物学基因领域,未划分训练/测试、数据/标签或原始/处理集,仅含一个压缩文件,无额外目录层级。 文件详解 文件名称:aiv-rate-heterogeneity-v1.1.zip...
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HiBC人类肠道细菌16S_rRNA基因序列数据20240620
数据集概述 本数据集包含人类肠道细菌集合(HiBC)中分离菌株的16S rRNA基因序列,涵盖已知细菌及待分类命名的新物种菌株。序列以FASTA核苷酸格式存储,通过Sanger测序技术或基因组序列提取获得,为微生物研究社区提供标准化基因序列资源。 文件详解 文件名称:HiBC_16S_rRNA_gene_sequences_20240620.zip...
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HiBC_Based人类肠道细菌基因组序列数据集20240717
数据集概述 本数据集为人类肠道细菌集合(HiBC)的基因组序列数据,包含从人类肠道分离的细菌菌株的16S rRNA基因序列、基因组序列及培养条件,涵盖已知细菌及新物种菌株,定期更新。本次提供的是FASTA核苷酸格式的基因组序列压缩包,质粒序列位于文件末尾,已修正前期错误及分类学拼写问题。 文件详解...



