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MD_SARS_CoV_2_Spike_Protein电场效应分子动力学模拟数据
2026年1月15日 30 111 90
数据集概述 本数据集包含SARS-CoV-2刺突蛋白片段及计算机模拟突变体在中等外电场下的全原子分子动力学模拟轨迹，部分模拟最终结构通过PyDOCK与ACE2受体进行计算机对接，以评估构象变化的影响。数据集共4个压缩文件，涵盖不同蛋白结构、突变体及对接结果。 文件详解 文件名称：trajectories_6vsb_dt1ns.zip 文件格式：ZIP...
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MD_Files_Based_FSHR和LHCGR糖蛋白受体SDPC脂质轨迹数据
2026年1月15日 30 109 86
数据集概述 本数据集包含糖蛋白受体FSHR和LHCGR在SDPC脂质中轨迹的MD文件，涵盖PSF、PDB结构文件及charmm36m力场参数文件。PDB与trr文件仅保留主链原子，所有帧均已拟合至跨膜结构域。数据集共15个文件，支持生物分子动力学模拟相关研究。 文件详解 结构文件包...
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archaerhodopsin_3_Based_视紫红质3结构建模与光谱计算数据
2026年1月15日 30 104 60
数据集概述 本数据集为视紫红质3（archaerhodopsin-3）的结构建模与光学性质计算相关数据，包含I-TASSER建模的输入文件、输出结果、后处理脚本、光谱计算输入文件及最终结构文件，支持光遗传学应用中电压依赖性荧光指示剂的研究。 文件详解 输入文件 文件名称：seq.fasta、P96787_1UAZ.fasta 文件格式：FASTA...
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Motif_KRAS_Based_基序引导识别KRAS互作蛋白实验数据_原始与结果归档
2026年1月14日 30 172 2
数据集概述 本数据集为基序引导识别KRAS互作蛋白相关的实验数据归档，包含BLI原始数据、KRAS/HRAS/NRAS/BRAF相关数据、二维结果、评分文件、Co-IP原始数据及输入PDB文件，共6个压缩文件，无分层目录结构，可支持蛋白质互作机制的相关研究。 文件详解 BLI_raw_data.zip 文件格式：ZIP...
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Visual_Integration_Based_真菌染色体三维模型组学数据整合补充数据
2026年1月13日 30 195 143
数据集概述 本数据集为论文“Visual integration of omics data to improve 3D models of fungal chromosomes”的补充数据，包含3DGB工作流所需的参数文件、生成的真菌基因组三维结构文件、代表性结构动画及原始组学数据分析汇总表，总计31个文件，用于支持真菌染色体三维模型的构建与分析。...
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ABCG36_Substrate_Specificity_拟南芥转运体MD_QM计算数据
2026年1月13日 30 23 7
数据集概述 本数据集包含拟南芥ABCG36/PDR8/PEN3转运体的坐标文件，用于分子动力学（MD）和量子力学（QM）计算，旨在研究ABCG转运体底物特异性的决定因素，重点关注全长拟南芥ABCG36转运体的胞外门关键残基对底物质量控制的作用。 文件详解 文件名称：README.md 文件格式：MD...
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Propeptides_Supplemental_蛋白生产研究前肽加工与生产促进补充数据
2026年1月13日 30 150 35
数据集概述 本数据集为论文《Propeptides: From Processing to Promotion of Protein Production》的补充数据，包含三十个文件，涵盖基因序列、蛋白质结构模型、实验视频及引物信息，主要涉及前肽（Propeptides）对蛋白生产的影响研究，支持蛋白质工程领域相关分析。 文件详解...
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RaptorX_Source_Huntingtin蛋白结构预测项目数据_20160329
2026年1月13日 30 115 17
数据集概述 本数据集为Huntingtin蛋白结构功能开放实验室笔记本项目的RaptorX结构预测数据，包含4个文件，主要涉及Huntingtin蛋白的结构预测结果及相关文档，支持对该蛋白结构的研究与分析。 文件详解 结构预测文件（.pdb格式） 文件名称：1-1200_besthit.pdb、2301-3144.pdb、1-1100.pdb...
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CHARMM_Drude_OpenMM_7_5_0_PURE_POPE膜分子动力学模拟数据
2026年1月12日 30 52 24
数据集概述 本数据集为采用CHARMM-Drude力场、通过OpenMM 7.5.0模拟引擎生成的纯POPE膜分子动力学模拟数据。包含300纳秒模拟数据（分3个子轨迹，每段100纳秒），共3000帧，采样频率100皮秒，前50纳秒为平衡期已剔除。数据涉及144个POPC脂质分子及5040个SWM4-NPD水分子，含修正时间戳的轨迹文件。 文件详解...
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OCE_Supplementary_Material_真菌孤儿候选效应因子结构与进化研究数据
2026年1月12日 30 25 19
数据集概述 本数据集为论文“Surface frustration re-patterning underlies the structural landscape and evolvability of fungal orphan candidate...
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GROMACS_CHARMM36m_Aβ肽与Cu_II_复合物水_二氯乙烷界面分子动力学模拟数据
2026年1月9日 30 177 38
数据集概述 本数据集包含三种系统的分子动力学模拟输入、参数及轨迹文件：Aβ₁₋₁₆在水/二氯乙烷界面（含TB⁻）、Aβ₄₋₁₆在水/二氯乙烷界面（含TB⁻）、Aβ₄₋₁₆–Cu(II)复合物在水/二氯乙烷界面（含TB⁻）。模拟基于GROMACS 2020.6与CHARMM36m力场，含TB⁻、BA+等有机离子参数，pH...
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Integrative_Structure_PTBP1_EMCV_IRES复合物溶液结构测定数据
2026年1月8日 30 54 9
数据集概述 本数据集包含RNA结合蛋白PTBP1与脑心肌炎病毒（EMCV）RNA内部核糖体进入位点（IRES）复合物的溶液整合结构模型及支撑数据，涵盖多组约束条件下的集合结构、DEER-EPR原始数据、SANS/SAXS曲线、约束文件及图表源数据，共27个文件，用于生物分子复合物结构研究。 文件详解 集合结构文件...
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ESRF_4XYD_Roseobacter_denitrificans硝酸还原酶晶体衍射图像数据
2026年1月8日 30 204 191
数据集概述 本数据集包含玫瑰杆菌（Roseobacter denitrificans）硝酸还原酶（NOR）晶体的X射线衍射图像，是PDB条目4XYD结构解析的原始数据来源。数据由ESRF收集，支持蛋白质三维结构研究，仅包含一个压缩文件。 文件详解 文件名称：RdNOR_diffraction_images_4xyd.zip 文件格式：ZIP...
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Melittin_Recombinant_Based同位素标记蜂毒肽重组表达与化学酰胺化研究数据_SI
2026年1月2日 30 195 160
数据集概述 本数据集为蜂毒肽（Melittin）相关研究的补充数据，包含7个补充表格和25个PDB结构文件，记录了阳离子膜裂解肽列表、蜂毒肽骨架化学位移、15N-1H耦合参数、AlphaFold模型与RDC数据的拟合分析结果，以及实验涉及的蛋白质原子坐标，支撑同位素标记蜂毒肽的重组表达与化学酰胺化研究。 文件详解 表格文件（Excel格式）...
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Molecular_Dynamic_Simulation_Based_CL5D加速SIRT6产物解离研究数据
2025年12月29日 30 126 32
数据集概述 本数据集包含CL5D加速SIRT6产物解离的分子动力学模拟相关数据，涵盖SIRT6及SIRT6-CL5D系统的初始结构、平衡结构快照、模拟配置文件及图表源数据，支持论文图表生成与模拟过程复现，总计包含14个文件。 文件详解 源数据文件 文件名称：Source Data.xlsx 文件格式：XLSX 字段映射介绍：用于生成论文正文图表的源数据...
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Pseudomonas_syringae_Supplementary_Data_PSSC基因组与毒力研究数据
2025年12月29日 30 51 46
数据集概述 本数据集为Pseudomonas syringae竞争与毒力研究的补充数据，包含2161个PSSC基因组的元数据、PCR引物评估结果、系统发育树、毒力因子HMM模型、基因检测结果、分类器及尾纤维结构预测等35个文件，支持相关章节的基因组分析、引物验证及毒力机制研究。 文件详解 基因组与元数据文件 文件名称：supplementary...
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Density_based_Many_body_Expansion_多肽与蛋白质密度基多体展开数据集_配套研究
2025年12月27日 30 175 151
数据集概述 本数据集为论文《The density-based many-body expansion for polypeptides and proteins》的配套数据，包含用于测试计算的结构文件、绘图脚本及输入脚本，支持复现论文中的计算与图表生成。 文件详解 压缩包文件 文件名称：dataset-zenodo-v2.zip 文件格式：ZIP...
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nmpro_x1311_PDB_5RFG_SARS_CoV_2_主蛋白酶与_PCM_0102372_复合物的原始衍射数据
2025年12月27日 30 67 22
数据集概述 本数据集包含SARS-CoV-2主蛋白酶与小分子PCM-0102372复合物的原始衍射数据，对应ID为mpro-x1311及PDB编号5RFG。数据由Diamond Light Source的i04-1光束线在XChem晶体学片段筛选实验中采集，原始数据可供重新分析使用。 文件详解 文件名称：mpro-x1311.zip 文件格式：ZIP...
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大鼠Arc蛋白与RNA相互作用及核酸伴侣功能研究数据集
2025年12月13日 30 131 8
数据集概述 本数据集包含支持大鼠Arc蛋白与RNA相互作用及核酸伴侣（NAC）活性研究的原始和处理数据，通过微量热泳动（MST）、NAC活性测定、RNA三维结构建模及蛋白-RNA复合物对接等方法获取，为相关分子机制研究提供数据支持。 文件详解 文件名称:...
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O_Buß与S_Jager补充数据集_β_酮酯酶水解HTS测定的统计评估
2025年12月25日 30 91 90
数据集概述 本数据集是O.Buß与S.Jager关于β-酮酯酶水解高通量筛选（HTS）测定统计评估研究的补充数据，包含计算用PDB结构文件、统计分析R脚本、活性测定校准数据及实验用酶的SDS-PAGE凝胶图片，为相关研究提供原始数据支持。 文件详解 该数据集包含5个文件，具体说明如下： - 统计分析R脚本压缩包: - 文件名称:...
