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RAD_seq_Evidence_Pitcairnia_lanuginosa局部适应研究数据
2026年1月17日 30 153 96
数据集概述 本数据集包含Neotropical凤梨科植物Pitcairnia lanuginosa的RAD-seq基因数据与性状数据，用于研究该斑块状分布物种在强遗传漂变下的局部适应证据。数据涵盖巴西塞拉多和安第斯永加斯种群的SNP标记及常见园实验的生理生态性状，支持种群分化、遗传漂变与选择作用的分析，共3个文件。 文件详解 种群基因数据压缩包...
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RAD_seq_MassARRAY_北美东部橡树核DNA条形码及植物园杂交研究数据
2026年1月15日 30 101 11
数据集概述 本数据集为北美东部8种常见白橡树核DNA条形码研究及植物园杂交分析相关数据。研究通过RAD-seq技术开发含80个SNP的条形码工具包，结合MassARRAY技术验证，分析Morton Arboretum中移栽橡树与本地树种的杂交情况。包含5个文件，涉及SNP提取脚本、不同筛选阶段的SNP矩阵及基因座序列压缩包。 文件详解...
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Pacific_cod_FISH_546_Based华盛顿大学课程基因数据分析项目数据
2026年1月14日 30 118 34
数据集概述 本数据集为华盛顿大学FISH 546课程期末项目的成果，包含太平洋鳕鱼RADseq基因数据的分析代码与中间结果。项目未完全完成，但已生成基因种群文件子集的DAPC分析结果及群体间成对Fst值计算结果，以压缩包形式存储相关分析脚本与笔记本。 文件详解 文件名称：FISH546-3.0.zip 文件格式：ZIP...
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Data_Like_a_rolling_stone_灰礁鲨种群进化历史与基因结构研究数据
2026年1月13日 30 45 14
数据集概述 本数据集包含灰礁鲨（Carcharhinus amblyrhynchos）种群进化历史研究的关键数据，涵盖印度-太平洋区域173个个体的RAD-seq基因位点分析结果，涉及种群扩张、基因连通性及遗传结构等内容，为该濒危物种的保护管理提供科学依据。 文件详解 README.txt 文件格式：TXT...
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Ecol_Apps_Morissette_et_al_2019_湖鳟生态型环境互作与营养生态位数据
2026年1月7日 30 168 113
数据集概述 本数据集围绕湖鳟（Salvelinus namaycush）的生态型-环境互作展开，包含养殖、本地及杂交个体的稳定同位素分析数据，以及遗传标记与生态性状关联分析结果，旨在研究养殖对种内营养生态位分化的影响，为渔业管理和保护提供数据支持。 文件详解 说明文档类...
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RADseq_Data_from_Hawaiian_Myrsine辐射进化系统发育与杂交分析数据集
2026年1月7日 30 61 6
数据集概述 本数据集包含夏威夷Myrsine属（报春花科）辐射进化的RADseq和Sanger测序系统发育分析结果，涉及近全部夏威夷Myrsine物种及全球Myrsine属和近缘属样本。数据支持夏威夷Myrsine单系性、三大分支结构的结论，并提供杂交事件的分子证据，共四十四份文件。 文件详解 系统发育树文件...
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系统发育基因组学测序方案计算机模拟比较数据集
2025年12月23日 30 195 176
数据集概述 本数据集基于23种灵长类动物基因组，对四种常用系统发育基因组学测序方案（UCE捕获、外显子捕获、RADseq、ddRADseq）进行计算机模拟比较，涵盖系统发育分辨率与分歧时间估算结果，为方案选择提供参考。 文件详解 文件名称: README_for_beast.tar.pdf 文件格式: PDF 内容说明:...
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红衣主教唐纳雀属系统基因组学测序方法比较数据集
2025年12月23日 30 38 2
数据集概述 本数据集围绕红衣主教唐纳雀属（Piranga）的系统基因组学研究展开，对比了RAD-seq和UCEs两种测序方法在不同分类水平下的系统发育推断效果，包含两种方法的测序数据、物种树分析结果及补充信息，为鸟类系统发育研究提供数据支持。 文件详解 压缩文件（.zip格式）： uce_raxml.zip：UCE数据的RAxML分析结果文件...
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RAD_seq系统发育学缺失数据误解研究数据集_开花植物案例
2025年12月20日 30 4 1
数据集概述 本数据集围绕RAD-seq系统发育学中的缺失数据误解展开，分析10个RAD-seq数据集的缺失数据分布，通过模拟区分突变干扰与测序覆盖度导致的缺失模式，并以开花植物荚蒾属为实证案例，探讨测序深度对系统发育信息的影响，提供实用建议。 文件详解 数据文件：...
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SNP系统发育推断的获取偏差校正数据集
2025年12月20日 30 135 112
数据集概述 本数据集围绕单核苷酸多态性（SNPs）在系统发育研究中的应用展开，包含计算机模拟数据及蜥蜴科（Phrynosomatidae）的双酶切RADseq（ddRADseq）实证数据，旨在评估RAD位点用于系统发育推断的准确性，并引入两种新的获取偏差校正方法。 文件详解 文件名称: SupplementMaterials.pdf 文件格式: PDF...
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南极磷虾种群基因组学研究数据集
2025年12月19日 30 176 37
数据集概述 本数据集为南极磷虾种群基因组学研究的成果数据，包含线粒体DNA（mtDNA）与RAD-seq（限制性位点相关DNA测序）分析结果，涉及五个采样点（含两个东极地点）的磷虾样本，验证了其种群遗传结构的泛交性特征，并探讨了大基因组生物RAD-seq分析的复杂性。 文件详解 项目说明文档（PDF格式）： README_for_1 RAD-seq...
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熊蜂物种分子数据支持的结构分析补充材料2024
2025年12月18日 30 2 0
数据集概述 该数据集为2024年发表的熊蜂物种分子研究的补充材料，包含基于RADseq数据的STRUCTURE分析结果，通过Clumpak工具输出，用于支持Bombus sonorus与Bombus pensylvanicus为不同物种的结论，为膜翅目昆虫分类学研究提供分子数据佐证。 文件详解 文件名称: oo_1155517.pdf 文件格式:...
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家燕基因组分化与选择地理隔离关联数据集
2025年12月18日 30 69 57
数据集概述 该数据集聚焦家燕（Hirundo rustica）近缘种群的基因组分化研究，结合基因型与表型数据，探究选择与地理隔离对种群分化的相对贡献。数据涵盖8个种群350个样本的9493个单核苷酸多态性（SNPs）及迁徙行为、性信号等表型指标，为解析隔离适应（IBA）与隔离距离（IBD）机制提供支持。 文件详解 文件名称:...
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斑马鱼实验室驯化遗传特征数据集
2025年12月12日 30 109 102
数据集概述 该数据集通过RAD-seq技术对印度、尼泊尔、孟加拉国的野生斑马鱼种群及四种常见实验室品系进行遗传特征分析，对比野生种群与实验室品系的遗传多样性、杂合度等指标，揭示实验室驯化对斑马鱼遗传背景的影响。 文件详解 wildlabdanio.vcf.gz：VCF压缩格式文件，包含野生斑马鱼种群及实验室品系的遗传变异数据...
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榆树属系统发育_生物地理学与分类数据集
2025年12月12日 30 102 38
数据集概述 该数据集围绕榆树属（Ulmus）展开，包含基于RAD-seq技术构建的系统发育树、修订的属内分类体系（含亚属和组的检索表、描述及分布图），并探讨了形态变异、种间杂交及洲际扩散等内容，为榆树属分类与演化研究提供数据支持。 文件详解 该数据集包含11个PDF格式的文件，具体说明如下： - 系统发育分析图文件： -...
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Triturus属蝾螈RADseq连锁图谱与Y染色体周转研究补充数据集
2025年12月7日 30 112 8
数据集概述 本数据集为Triturus属蝾螈Y染色体周转研究的补充资料，包含RADseq连锁图谱的标记序列及位置信息，以及构建该图谱所用的分析脚本，支持对蝾螈性别染色体起源与平衡致死系统关系的研究验证。 文件详解 文件名称：Scripts.zip，文件格式：ZIP压缩包，内容：包含构建RADseq连锁图谱的分析脚本（脚本同步托管于GitHub仓库）...
