数据集概述
本数据集围绕Antennaria属（菊科鼠麴草族）的系统发育关系展开，包含基于核基因和叶绿体基因的系统发育树、生物地理分析数据、形态特征演化及分子钟年代估算等相关文件，为该属的进化研究、多倍体起源及无融合生殖机制提供基础框架，共含18个文件。
文件详解
- 表格文件（XLSX格式，7个）
- 文件名称：Table_S1至Table_S7系列表格（如Table_S1_Study_taxa_with_sequencing_information.xlsx、Table_S3_Information_on_data_matrix_of_nuclear_genes.xlsx等）
- 字段映射：涵盖研究类群测序信息、核基因/叶绿体基因矩阵信息、基因拷贝数统计、生物地理矩阵、模型比较结果、BSM计数汇总等分类学与统计数据
- 系统发育树文件（TRE格式，5个）
- 文件名称：Fig1a_MrBayes_Tree_Nuclear_756_Genes.tre、Fig1b_Mustispecies_coalescence_ASTRALII_Tree__565_Genes.tre等
- 内容：基于核基因（756个、280个等）的MrBayes/RAxML树，以及基于多物种 coalescence 方法的ASTRALII树
- 系统发育分析文件（NEX格式，4个）
- 文件名称：FigS5_Chloroplast_Tree_MrBVayes.nex、Fig3_TreePL_Time_Calibrated_Antennaria_Tree.nex等
- 内容：叶绿体基因的MrBayes/RAxML树文件、时间校准的Antennaria属系统发育树
- 序列比对文件（FASTA格式，1个）
- 文件名称：Alignment_matrix_756_Genes.fasta
- 内容：756个核基因的序列比对矩阵
- 补充文档（DOCX格式，1个）
- 文件名称：Supplemental_File_S1.docx
- 内容：数据集相关的补充说明文档
数据来源
论文“Phylogenomics resolves the relationships within Antennaria (Asteraceae, Gnaphalieae) and yields new insights into its morphological character evolution and biogeography”
适用场景
- Antennaria属系统发育研究：利用核基因/叶绿体基因树分析该属的分类关系与单系性验证
- 生物地理演化分析：基于生物地理矩阵与模型比较结果，探究该属的起源中心及扩散路径
- 形态特征演化研究：结合系统发育框架解析12个分类学重要形态特征的演化模式
- 分子钟年代估算：通过时间校准树文件研究该属的分化时间与历史生物地理事件
- 多倍体与无融合生殖机制研究：为后续分析该属多倍体起源及无融合生殖的进化提供基础数据
