数据集概述
本数据集为论文《An Atlas of Plant Transposable Elements》的支持数据，包含补充材料与代码软件压缩包，用于支撑植物转座子注释流程的复现与验证。数据涵盖Ensembl Plants物种基因组参考信息、转座子注释步骤说明及完整分析代码，总计3个文件，是植物基因组转座子研究的辅助资源。
文件详解
- 补充材料文件
- 文件名称：SuppMat_1.xlsx
- 文件格式：XLSX
- 字段映射介绍：包含Ensembl Plants数据库中所用物种的基因组组装参考 accession 信息
- 文件名称：SuppMat_2.docx
- 文件格式：DOCX
- 字段映射介绍：记录本研究中转座子注释的简要步骤说明
- 代码软件压缩包
- 文件名称：alerpaschoal/apte_pipeline-v1.0.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含所有分析脚本代码、第三方软件使用说明（以拟南芥基因组为例），对应GitHub仓库为https://github.com/alerpaschoal/apte_pipeline，遵循MIT许可
数据来源
论文《An Atlas of Plant Transposable Elements》
适用场景
- 植物基因组转座子注释：参考SuppMat_2.docx中的步骤，复现或优化植物转座子注释流程
- 基因组参考数据查询：通过SuppMat_1.xlsx获取Ensembl Plants物种的基因组组装信息
- 生物信息学流程复现：利用压缩包内的代码脚本，基于拟南芥案例复现转座子分析流程
- 转座子研究辅助分析：为植物转座子图谱相关的基因组学研究提供数据与技术支撑
