数据集概述
本数据集来自论文“Discovery and characterization of 80 SNPs and 1,624 SSRs in the transcriptome of Atlantic mackerel (Scomber scombrus, L)”，包含大西洋鲭鱼转录组中开发的分子标记数据，涉及高质量转录组contig组装、SNP和SSR筛选及基因分型结果，可用于种群遗传结构分析和产品溯源研究。
文件详解
- dryad.xlsx：XLSX格式，包含大西洋鲭鱼转录组中筛选出的479个候选SNP和1624个SSR标记的相关信息
- alignments.zip：ZIP格式，压缩文件，推测包含转录组测序数据的比对结果文件
- variants.zip：ZIP格式，压缩文件，推测包含SNP和SSR标记的变异检测结果文件
- ssco_trans_filtered.fasta：FASTA格式，包含过滤后的大西洋鲭鱼转录组contig序列
数据来源
论文“Discovery and characterization of 80 SNPs and 1,624 SSRs in the transcriptome of Atlantic mackerel (Scomber scombrus, L)”
适用场景
- 种群遗传结构研究：利用80个多态性SNP标记分析大西洋鲭鱼不同地理种群的遗传多样性和种群分化
- 渔业产品溯源：基于开发的分子标记建立大西洋鲭鱼产品的产地溯源技术体系
- 分子标记辅助育种：筛选的SSR标记可用于大西洋鲭鱼的遗传育种和种质资源评估
- 转录组功能分析：通过转录组contig序列研究大西洋鲭鱼重要功能基因的表达和调控机制
