数据集概述
本数据集是“变形虫微RNA进化与多细胞起源意义”研究的配套资源，包含微RNA的筛选、分析脚本及相关数据文件，支持复现研究中的微RNA鉴定、进化分析及基因组注释获取等流程，为探究微RNA在变形虫多细胞起源中的作用提供完整的研究工具与数据支持。
文件详解
- 示例运行文件：
- example_run.zip：压缩文件，包含示例运行脚本（explore_all.sh、refine_all.sh）、示例小RNA序列（example_sizeselected_data）及候选微RNA序列（pot-miRNAs_merged.fa），用于演示微RNA筛选流程
- 分析脚本与报告：
- amoeba_miRNAevo.Rmd：R Markdown格式文件，为微RNA进化分析的主脚本
- amoeba_miRNAevo.pdf：PDF格式文件，可能是微RNA进化分析的报告输出
- 数据文件：
- data_in.zip：压缩文件，包含分析输入数据，多来自微RNA筛选脚本及辅助脚本输出
- data_out.zip：压缩文件，包含分析生成的表格及其他数据
- 辅助脚本：
- helper_scripts.zip：压缩文件，包含辅助分析脚本，如微RNA保守性搜索脚本、参考基因组下载脚本（get_references.sh）
- 可视化文件：
- plots.zip：压缩文件，包含分析生成的图表
适用场景
- 分子进化研究：分析变形虫微RNA的进化模式及保守性
- 多细胞起源机制研究：探究微RNA在变形虫多细胞起源中的作用
- 生物信息学方法验证：复现微RNA筛选与进化分析的流程与方法
- 基因组学研究：获取变形虫（如网柄菌、棘变形虫）的基因组及注释数据
