数据集概述
本数据集围绕熊蜂(Bombus terrestris)肠道菌群多样性与肠道寄生虫(Crithidia bombi)感染抗性的关系展开,包含实验样本的元数据、OTU计数、OTU分类信息及参考序列,用于探究感染前肠道菌群结构对寄生虫感染结果的影响,共含4个文件。
文件详解
- D1_Metadata_Samples.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:实验样本的元数据文件,包含样本基本信息
- D2_OTUcounts.txt
- 文件格式:TXT
- 字段映射介绍:OTU计数表,含Sample_ID及各OTU(如OTU_315、OTU_452等)的计数数据
- D4_OTUTaxonomy.xlsx
- 文件格式:XLSX
- 字段映射介绍:OTU分类信息文件,记录各OTU的分类学注释
- D3_OTUreferenceSequences.fa
- 文件格式:FA
- 字段映射介绍:OTU参考序列文件,存储各OTU对应的16S rRNA基因序列
数据来源
论文“High gut microbiota diversity provides lower resistance against infection by an intestinal parasite in bumblebees”
适用场景
- 肠道微生物组与宿主抗性研究:分析熊蜂肠道菌群多样性对寄生虫感染抗性的影响机制
- 微生物群落结构分析:通过OTU计数与分类数据研究熊蜂肠道菌群的组成特征
- 寄生虫感染生态研究:探究肠道菌群与寄生虫感染结果的关联性
- 生物信息学分析:基于OTU参考序列开展序列比对、系统发育等生物信息学分析