数据集概述
本数据集围绕Candidatus Thiosymbion共生菌展开，包含其与线虫（Stilbonematinae）外共生、环节动物（Phallodrilinae）内共生的序列比对、系统发育树等数据，用于研究两类宿主与共生菌的协同进化关系，分析共生生活方式转换及宿主跨界转移的进化事件。
文件详解
- 说明文档（.txt）
- 文件名称：README_for_Sequence_alignments_gutless_Phallodrilinae_endosymbioses.txt、README_for_Sequence_alignments_Stilbonematinae_ectosymbioses.txt
- 文件格式：TXT
- 字段映射介绍：包含共生菌与宿主序列比对的说明信息，如Stilbonematine线虫宿主18S rRNA基因的编号（如CB2W140对应KP943955）等
- 序列比对文件（.zip、.fasta）
- 文件名称：Sequence_alignments_Stilbonematinae_ectosymbioses.zip、Sequence_alignments_gutless_Phallodrilinae_endosymbioses.zip、Sequence_alignment_Cand_Thiosymbionts_16SrRNA.fasta
- 文件格式：ZIP、FASTA
- 字段映射介绍：包含共生菌与两类宿主的序列比对数据，其中.fasta文件为Cand.Thiosymbion共生菌16S rRNA基因的序列比对结果
- 系统发育树文件（.tre）
- 文件名称：RAxML_all_Cand_Thiosymbionts_16SrRNA.tre、mrbayes_all_Cand_Thiosymbionts_16SrRNA.tre
- 文件格式：TRE
- 字段映射介绍：基于RAxML和MrBayes方法构建的Cand.Thiosymbion共生菌16S rRNA基因系统发育树
- 系统发育分析压缩包（.zip）
- 文件名称：RAxML_phylogenies_Stilbonematinae.zip、RAxML_phylogenies_gutless_Phallodrilinae.zip、Baysian_inference_phylogenies_Stilbonematinae.zip、Bayesian_inference_gutless_Phallodrilinae.zip
- 文件格式：ZIP
- 字段映射介绍：包含针对Stilbonematinae线虫外共生、Phallodrilinae环节动物内共生的RAxML和贝叶斯推断系统发育分析结果
数据来源
论文“Closely coupled evolutionary history of ecto- and endosymbionts from two distantly related animal phyla”
适用场景
- 微生物生态学研究：分析Cand.Thiosymbion共生菌与两类海洋动物宿主的协同进化关系
- 共生关系进化分析：探究共生菌在不同宿主间、不同共生生活方式（外共生/内共生）的转换事件
- 系统发育树构建参考：为海洋共生菌的系统发育研究提供序列比对和树结构数据
- 宿主-共生菌特异性研究：通过协同进化分析，研究共生菌对不同宿主的适应性机制
