CCFZ_Based_东太平洋深海沉积物179个高质量MAGs序列与注释数据

数据集概述

本数据集包含从东太平洋克拉里昂-克利珀顿断裂带(CCFZ)深海锰结核附近沉积物样本中重建的179个高质量宏基因组组装基因组(MAGs)的序列及注释信息。通过对7个沉积物样本的宏基因组测序、组装和分箱分析获得,为深海微生物资源研究提供基础数据。

文件详解

  • README.txt
  • 文件格式:TXT
  • 内容介绍:说明每个MAG对应的三个文件类型及注释文件字段,包括基因组序列FASTA文件、预测蛋白质序列FASTA文件,以及含7列数据的蛋白质功能注释表(基因ID、 contig ID等)。
  • genome_and_annotations.zip
  • 文件格式:ZIP
  • 内容介绍:压缩包包含所有179个MAGs的基因组序列文件(_genome.fna)、蛋白质序列文件(_proteins.faa)和蛋白质功能注释文件(*_proteins_annotation.txt)。

适用场景

  • 深海微生物多样性研究:分析CCFZ区域深海沉积物中微生物群落的物种组成与基因组特征。
  • 微生物功能基因挖掘:通过注释信息筛选与深海环境适应相关的功能基因(如金属代谢、极端环境耐受基因)。
  • 深海生物资源开发:为深海微生物酶、代谢产物等生物资源的开发提供基因组数据支撑。
  • 宏基因组学方法验证:用于评估深海环境下宏基因组组装、分箱及注释流程的准确性与效率。
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数据与资源

附加信息

字段
作者 Maxj
版本 1
数据集大小 241.46 MiB
最后更新 2026年1月20日
创建于 2026年1月20日
声明 当前数据集部分源数据来源于公开互联网,如果有侵权,请24小时联系删除(400-600-6816)。